RNA–Protein interactions for RNA: YDL105W

NSE4, Transcript of Component of the SMC5-SMC6 complex, yeast

Gene NSE4, Length 1,209 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
NSE4	YDL105W	ENB1	Q08299	606 aa		5	□□□□□ -1.61
NSE4	YDL105W	KCS1	Q12494	1050 aa		5	□□□□□ -1.61
NSE4	YDL105W	YKL151C	P36059	337 aa		4.99	□□□□□ -1.61
NSE4	YDL105W	ECM21	P38167	1117 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
NSE4	YDL105W	SRT1	Q03175	343 aa		4.99	□□□□□ -1.61
NSE4	YDL105W	CDA1	Q06702	301 aa		4.99	□□□□□ -1.61
NSE4	YDL105W	SPE1	P08432	466 aa		4.98	□□□□□ -1.61
NSE4	YDL105W	HSF1	P10961	833 aa		4.98	□□□□□ -1.61
NSE4	YDL105W	CCC2	P38995	1004 aa		4.98	□□□□□ -1.61
NSE4	YDL105W	ATG19	P35193	415 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NSE4	YDL105W	GIC1	P38785	314 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NSE4	YDL105W	SAH1	P39954	449 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
NSE4	YDL105W	SRP1	Q02821	542 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
NSE4	YDL105W	CLN2	P20438	545 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NSE4	YDL105W	SRP101	P32916	621 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NSE4	YDL105W	EFT1	P32324	842 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
NSE4	YDL105W	RPC82	P32349	654 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NSE4	YDL105W	STU2	P46675	888 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NSE4	YDL105W	FAA4	P47912	694 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
NSE4	YDL105W	GDE1	Q02979	1223 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NSE4	YDL105W	NPC2	Q12408	173 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NSE4	YDL105W	SBA1	P28707	216 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
NSE4	YDL105W	ABD1	P32783	436 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
NSE4	YDL105W	PAM1	P37304	830 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
NSE4	YDL105W	URM1	P40554	99 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
NSE4	YDL105W	JIP5	Q06214	492 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
NSE4	YDL105W	ESC2	Q06340	456 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NSE4	YDL105W	GUP2	Q08929	609 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NSE4	YDL105W	AGP1	P25376	633 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NSE4	YDL105W	CDC12	P32468	407 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
NSE4	YDL105W	MAD1	P40957	749 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NSE4	YDL105W	NCS6	P53088	359 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NSE4	YDL105W	YOL073C	Q08232	322 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NSE4	YDL105W	FAL1	Q12099	399 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
NSE4	YDL105W	KTR4	P38131	464 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NSE4	YDL105W	ATF1	P40353	525 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NSE4	YDL105W	QRI1	P43123	477 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
NSE4	YDL105W	NPL3	Q01560	414 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.92	□□□□□ -1.62	not detected
NSE4	YDL105W	MCH5	Q08777	521 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NSE4	YDL105W	SUL1	P38359	859 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NSE4	YDL105W	MBP1	P39678	833 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NSE4	YDL105W	GYP7	P48365	746 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NSE4	YDL105W	DUS3	Q06053	668 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
NSE4	YDL105W	BDF2	Q07442	638 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NSE4	YDL105W	YLR040C	Q07988	224 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NSE4	YDL105W	LAS17	Q12446	633 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NSE4	YDL105W	NPP2	P39997	493 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NSE4	YDL105W	CWC24	P53769	259 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NSE4	YDL105W	SFB2	P53953	876 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NSE4	YDL105W	TMN2	Q04562	672 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NSE4	YDL105W	YPR196W	Q06595	470 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NSE4	YDL105W	OMS1	Q06668	471 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NSE4	YDL105W	KAR4	P25583	335 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NSE4	YDL105W	YKR078W	P36158	585 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
NSE4	YDL105W	BUL1	P48524	976 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NSE4	YDL105W	TIM44	Q01852	431 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NSE4	YDL105W	SHE9	Q04172	456 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NSE4	YDL105W	PIN2	Q12057	282 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NSE4	YDL105W	YER158C	P40095	573 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NSE4	YDL105W	SNM1	P40993	198 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NSE4	YDL105W	WHI4	Q07655	649 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
NSE4	YDL105W	ACF2	Q12168	779 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NSE4	YDL105W	VBA5	P36172	582 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NSE4	YDL105W	GUS1	P46655	708 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.87	□□□□□ -1.63	not detected
NSE4	YDL105W	STB4	P50104	949 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NSE4	YDL105W	RAI1	P53063	387 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
NSE4	YDL105W	VPS16	Q03308	798 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NSE4	YDL105W	CAD1	P24813	409 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
NSE4	YDL105W	ERG4	P25340	473 aa		4.86	□□□□□ -1.63
NSE4	YDL105W	SED4	P25365	1065 aa		4.86	□□□□□ -1.63
NSE4	YDL105W	CDC48	P25694	835 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
NSE4	YDL105W	CUE2	P36075	443 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
NSE4	YDL105W	IRC10	Q08118	586 aa		4.86	□□□□□ -1.63
NSE4	YDL105W	OPI10	Q08202	246 aa		4.86	□□□□□ -1.63
NSE4	YDL105W	UPC2	Q12151	913 aa		4.86	□□□□□ -1.63
NSE4	YDL105W	TRP4	P07285	380 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
NSE4	YDL105W	PPH3	P32345	308 aa		4.85	□□□□□ -1.63
NSE4	YDL105W	TSL1	P38427	1098 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
NSE4	YDL105W	RNT1	Q02555	471 aa		4.85	□□□□□ -1.63
NSE4	YDL105W	YDR306C	Q06640	478 aa		4.85	□□□□□ -1.63
NSE4	YDL105W	ADE8	P04161	214 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NSE4	YDL105W	MRP8	P35719	219 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NSE4	YDL105W	YBR238C	P38330	731 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
NSE4	YDL105W	TPO2	P53283	614 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NSE4	YDL105W	NOT3	P06102	836 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
NSE4	YDL105W	STE14	P32584	239 aa		4.83	□□□□□ -1.64
NSE4	YDL105W	VAC8	P39968	578 aa		4.83	□□□□□ -1.64
NSE4	YDL105W	YKE2	P52553	114 aa		4.83	□□□□□ -1.64
NSE4	YDL105W	ALD6	P54115	500 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
NSE4	YDL105W	LGE1	Q02796	332 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
NSE4	YDL105W	VPS30	Q02948	557 aa		4.83	□□□□□ -1.64
NSE4	YDL105W	AAR2	P32357	355 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
NSE4	YDL105W	PBY1	P38254	753 aa		4.82	□□□□□ -1.64
NSE4	YDL105W	PRI2	P20457	528 aa		4.81	□□□□□ -1.64
NSE4	YDL105W	SCT1	P32784	759 aa		4.81	□□□□□ -1.64
NSE4	YDL105W	YMR206W	Q03695	313 aa		4.81	□□□□□ -1.64
NSE4	YDL105W	NPP1	P25353	742 aa		4.8	□□□□□ -1.64
NSE4	YDL105W	STE13	P33894	931 aa		4.8	□□□□□ -1.64
NSE4	YDL105W	YKL069W	P36088	180 aa		4.8	□□□□□ -1.64
NSE4	YDL105W	YRO2	P38079	344 aa		4.8	□□□□□ -1.64

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