RNA–Protein interactions for RNA: YOL093W

TRM10, Transcript of tRNA methyltransferase, yeast

Gene TRM10, Length 882 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
TRM10	YOL093W	RRI2	Q12348	645 aa		5.78	□□□□□ -1.48
TRM10	YOL093W	POM152	P39685	1337 aa		5.77	□□□□□ -1.49
TRM10	YOL093W	RPS9B	P05755	195 aa	Known RBP	5.77	□□□□□ -1.49
TRM10	YOL093W	BRE1	Q07457	700 aa	Known RBP	5.77	□□□□□ -1.49
TRM10	YOL093W	GRX6	Q12438	231 aa		5.77	□□□□□ -1.49
TRM10	YOL093W	CDC16	P09798	840 aa		5.76	□□□□□ -1.49
TRM10	YOL093W	SMC1	P32908	1225 aa		5.76	□□□□□ -1.49
TRM10	YOL093W	FLR1	P38124	548 aa		5.76	□□□□□ -1.49
TRM10	YOL093W	ECM21	P38167	1117 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
TRM10	YOL093W	OSH3	P38713	996 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
TRM10	YOL093W	NUG1	P40010	520 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
TRM10	YOL093W	YIL165C	P40446	119 aa		5.76	□□□□□ -1.49
TRM10	YOL093W	KAR5	Q04746	504 aa		5.76	□□□□□ -1.49
TRM10	YOL093W	PSF3	Q12146	194 aa		5.76	□□□□□ -1.49
TRM10	YOL093W	NOT3	P06102	836 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
TRM10	YOL093W	VAS1	P07806	1104 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
TRM10	YOL093W	HSP78	P33416	811 aa		5.75	□□□□□ -1.49
TRM10	YOL093W	NTA1	P40354	457 aa		5.75	□□□□□ -1.49
TRM10	YOL093W	INP51	P40559	946 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
TRM10	YOL093W	SUT1	P53032	299 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
TRM10	YOL093W	ERO1	Q03103	563 aa		5.75	□□□□□ -1.49
TRM10	YOL093W	ADR1	P07248	1323 aa		5.74	□□□□□ -1.49
TRM10	YOL093W	CTT1	P06115	562 aa		5.74	□□□□□ -1.49
TRM10	YOL093W	FRD1	P32614	470 aa	Known RBP	5.74	□□□□□ -1.49
TRM10	YOL093W	AIM46	P38885	310 aa		5.74	□□□□□ -1.49
TRM10	YOL093W	STM1	P39015	273 aa	Known RBP	5.74	□□□□□ -1.49
TRM10	YOL093W	BOL3	P39724	118 aa		5.74	□□□□□ -1.49
TRM10	YOL093W	YGL242C	P53066	181 aa		5.74	□□□□□ -1.49
TRM10	YOL093W	GUP1	P53154	560 aa		5.74	□□□□□ -1.49
TRM10	YOL093W	UBP16	Q02863	499 aa		5.74	□□□□□ -1.49
TRM10	YOL093W	THI3	Q07471	609 aa		5.74	□□□□□ -1.49
TRM10	YOL093W	FAS2	P19097	1887 aa	Known RBP	5.74	□□□□□ -1.49
TRM10	YOL093W	SMY1	P32364	656 aa	Known RBP	5.73	□□□□□ -1.49
TRM10	YOL093W	CDC3	P32457	520 aa	Known RBP	5.73	□□□□□ -1.49
TRM10	YOL093W	GEF1	P37020	779 aa		5.73	□□□□□ -1.49
TRM10	YOL093W	BOI1	P38041	980 aa	Known RBP	5.73	□□□□□ -1.49
TRM10	YOL093W	ERT1	P38140	529 aa		5.73	□□□□□ -1.49
TRM10	YOL093W	PBY1	P38254	753 aa		5.73	□□□□□ -1.49
TRM10	YOL093W	RAD55	P38953	406 aa		5.73	□□□□□ -1.49
TRM10	YOL093W	FPR4	Q06205	392 aa	Predicted RBP	5.73	□□□□□ -1.49
TRM10	YOL093W	ELG1	Q12050	791 aa		5.73	□□□□□ -1.49
TRM10	YOL093W	SEC18	P18759	758 aa	Known RBP	5.72	□□□□□ -1.49
TRM10	YOL093W	MGM1	P32266	881 aa		5.72	□□□□□ -1.49
TRM10	YOL093W	LEM3	P42838	414 aa		5.72	□□□□□ -1.49
TRM10	YOL093W	NSI1	Q12457	570 aa		5.72	□□□□□ -1.49
TRM10	YOL093W	ERS1	P17261	260 aa		5.71	□□□□□ -1.5
TRM10	YOL093W	RPB10	P22139	70 aa		5.71	□□□□□ -1.5
TRM10	YOL093W	WHI3	P34761	661 aa	Known RBP	5.71	□□□□□ -1.5
TRM10	YOL093W	IRS4	P36115	615 aa	Known RBP	5.71	□□□□□ -1.5
TRM10	YOL093W	MMM1	P41800	426 aa		5.71	□□□□□ -1.5
TRM10	YOL093W	ATG1	P53104	897 aa		5.71	□□□□□ -1.5
TRM10	YOL093W	YNL193W	P53870	558 aa		5.71	□□□□□ -1.5
TRM10	YOL093W	UFD2	P54860	961 aa		5.71	□□□□□ -1.5
TRM10	YOL093W	EMG1	Q06287	252 aa	Known RBP	5.71	□□□□□ -1.5
TRM10	YOL093W	TAD3	Q9URQ3	322 aa		5.71	□□□□□ -1.5
TRM10	YOL093W	RNR2	P09938	399 aa	Known RBP	5.7	□□□□□ -1.5
TRM10	YOL093W	TFA2	P36145	328 aa		5.7	□□□□□ -1.5
TRM10	YOL093W	BRN1	P38170	754 aa		5.7	□□□□□ -1.5
TRM10	YOL093W	GLO3	P38682	493 aa	Known RBP	5.7	□□□□□ -1.5
TRM10	YOL093W	RRP8	P38961	392 aa	Known RBP	5.7	□□□□□ -1.5
TRM10	YOL093W	RGD2	P43556	714 aa		5.7	□□□□□ -1.5
TRM10	YOL093W	RPT4	P53549	437 aa	Known RBP	5.7	□□□□□ -1.5
TRM10	YOL093W	BIO5	P53744	561 aa	Known RBP	5.7	□□□□□ -1.5
TRM10	YOL093W	RMD1	Q03441	430 aa		5.7	□□□□□ -1.5
TRM10	YOL093W	SOG2	Q08817	791 aa		5.7	□□□□□ -1.5
TRM10	YOL093W	RIM20	Q12033	661 aa		5.7	□□□□□ -1.5
TRM10	YOL093W	CYB2	P00175	591 aa		5.69	□□□□□ -1.5
TRM10	YOL093W	KRE2	P27809	442 aa		5.69	□□□□□ -1.5
TRM10	YOL093W	YIR014W	P40570	242 aa		5.69	□□□□□ -1.5
TRM10	YOL093W	KRI1	P42846	591 aa	Known RBP	5.69	□□□□□ -1.5
TRM10	YOL093W	IRC8	P47046	822 aa		5.69	□□□□□ -1.5
TRM10	YOL093W	EAF6	P47128	113 aa		5.69	□□□□□ -1.5
TRM10	YOL093W	MRPS35	P53292	345 aa		5.69	□□□□□ -1.5
TRM10	YOL093W	SEN54	Q02825	467 aa	Predicted RBP	5.69	□□□□□ -1.5
TRM10	YOL093W	PRP6	P19735	899 aa	Predicted RBP	5.68	□□□□□ -1.5
TRM10	YOL093W	OPI1	P21957	404 aa		5.68	□□□□□ -1.5
TRM10	YOL093W	YKU70	P32807	602 aa		5.68	□□□□□ -1.5
TRM10	YOL093W	MDL2	P33311	773 aa		5.68	□□□□□ -1.5
TRM10	YOL093W	KTR2	P33550	425 aa		5.68	□□□□□ -1.5
TRM10	YOL093W	PSY2	P40164	858 aa		5.68	□□□□□ -1.5
TRM10	YOL093W	QDR1	P40475	563 aa		5.68	□□□□□ -1.5
TRM10	YOL093W	CIT3	P43635	486 aa		5.68	□□□□□ -1.5
TRM10	YOL093W	ACF4	P47129	309 aa		5.68	□□□□□ -1.5
TRM10	YOL093W	SPO71	Q03868	1245 aa		5.68	□□□□□ -1.5
TRM10	YOL093W	RPN7	Q06103	429 aa	Known RBP	5.68	□□□□□ -1.5
TRM10	YOL093W	ACK1	Q07622	623 aa	Predicted RBP	5.68	□□□□□ -1.5
TRM10	YOL093W	SSF2	Q12153	453 aa	Predicted RBP	5.68	□□□□□ -1.5
TRM10	YOL093W	TIF6	Q12522	245 aa	Known RBP	5.68	□□□□□ -1.5
TRM10	YOL093W	TOP1	P04786	769 aa		5.67	□□□□□ -1.5
TRM10	YOL093W	FUS1	P11710	512 aa		5.67	□□□□□ -1.5
TRM10	YOL093W	CAF20	P12962	161 aa	Known RBP	5.67	□□□□□ -1.5
TRM10	YOL093W	SHC1	P39000	512 aa		5.67	□□□□□ -1.5
TRM10	YOL093W	YMR147W	P40218	223 aa	Known RBP	5.67	□□□□□ -1.5
TRM10	YOL093W	SPO22	P40511	975 aa		5.67	□□□□□ -1.5
TRM10	YOL093W	IOC3	P43596	787 aa		5.67	□□□□□ -1.5
TRM10	YOL093W	IRC4	Q03036	179 aa		5.67	□□□□□ -1.5
TRM10	YOL093W	CRF1	Q04930	467 aa		5.67	□□□□□ -1.5
TRM10	YOL093W	MSM1	P22438	575 aa		5.66	□□□□□ -1.5
TRM10	YOL093W	SKI2	P35207	1287 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.66	□□□□□ -1.5	not detected
TRM10	YOL093W	AAP1	P37898	856 aa	Known RBP	5.66	□□□□□ -1.5

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