RNA–Protein interactions for RNA: YGR129W

SYF2, Transcript of Member of the NineTeen Complex (NTC), yeast

Gene SYF2, Length 648 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SYF2	YGR129W	GRX7	P38068	203 aa		7.06	□□□□□ -1.28
SYF2	YGR129W	STM1	P39015	273 aa	Known RBP	7.06	□□□□□ -1.28
SYF2	YGR129W	RSC8	P43609	557 aa	Known RBP	7.06	□□□□□ -1.28
SYF2	YGR129W	RMD1	Q03441	430 aa		7.06	□□□□□ -1.28
SYF2	YGR129W	FAB1	P34756	2278 aa		7.05	□□□□□ -1.28
SYF2	YGR129W	PRE8	P23639	250 aa		7.05	□□□□□ -1.28
SYF2	YGR129W	UTR4	P32626	227 aa		7.05	□□□□□ -1.28
SYF2	YGR129W	GUA1	P38625	525 aa	Known RBP	7.05	□□□□□ -1.28
SYF2	YGR129W	FOL2	P51601	243 aa	Known RBP	7.05	□□□□□ -1.28
SYF2	YGR129W	MCM6	P53091	1017 aa	Known RBP	7.05	□□□□□ -1.28
SYF2	YGR129W	NAF1	P53919	492 aa	Known RBP	7.05	□□□□□ -1.28
SYF2	YGR129W	HPF1	Q05164	967 aa		7.05	□□□□□ -1.28
SYF2	YGR129W	YKR018C	P36114	725 aa		7.04	□□□□□ -1.28
SYF2	YGR129W	YGR125W	P53273	1036 aa		7.04	□□□□□ -1.28
SYF2	YGR129W	CSI1	Q04368	295 aa		7.04	□□□□□ -1.28
SYF2	YGR129W	MSC6	Q08818	692 aa	Known RBP	7.04	□□□□□ -1.28
SYF2	YGR129W	SRM1	P21827	482 aa		7.03	□□□□□ -1.28
SYF2	YGR129W	ROG3	P43602	733 aa		7.03	□□□□□ -1.28
SYF2	YGR129W	ALD6	P54115	500 aa	Known RBP	7.03	□□□□□ -1.28
SYF2	YGR129W	RPS19A	P07280	144 aa	Known RBP	7.02	□□□□□ -1.29
SYF2	YGR129W	RPS19B	P07281	144 aa	Predicted RBP	7.02	□□□□□ -1.29
SYF2	YGR129W	STE6	P12866	1290 aa		7.02	□□□□□ -1.29
SYF2	YGR129W	YUR1	P26725	428 aa		7.02	□□□□□ -1.29
SYF2	YGR129W	TRK2	P28584	889 aa		7.02	□□□□□ -1.29
SYF2	YGR129W	OSH7	P38755	437 aa		7.02	□□□□□ -1.29
SYF2	YGR129W	SOL4	P53315	255 aa		7.02	□□□□□ -1.29
SYF2	YGR129W	DAK1	P54838	584 aa	Known RBP	7.02	□□□□□ -1.29
SYF2	YGR129W	STE20	Q03497	939 aa	Known RBP	7.02	□□□□□ -1.29
SYF2	YGR129W	RPP0	P05317	312 aa	Known RBP	7.01	□□□□□ -1.29
SYF2	YGR129W	RAD18	P10862	487 aa		7.01	□□□□□ -1.29
SYF2	YGR129W	SSF1	P38789	453 aa	Predicted RBP	7.01	□□□□□ -1.29
SYF2	YGR129W	SCS3	P53012	380 aa		7.01	□□□□□ -1.29
SYF2	YGR129W	VID30	P53076	958 aa		7.01	□□□□□ -1.29
SYF2	YGR129W	SKG3	Q06315	1026 aa		7.01	□□□□□ -1.29
SYF2	YGR129W	FRA1	Q07825	749 aa		7.01	□□□□□ -1.29
SYF2	YGR129W	YPL260W	Q08977	551 aa		7.01	□□□□□ -1.29
SYF2	YGR129W	RTP1	Q12751	981 aa		7.01	□□□□□ -1.29
SYF2	YGR129W	POX1	P13711	748 aa		7	□□□□□ -1.29
SYF2	YGR129W	POT1	P27796	417 aa	Known RBP RIP-Chip data	7	□□□□□ -1.29	not detected
SYF2	YGR129W	MAP1	Q01662	387 aa	Known RBP RIP-Chip data	7	□□□□□ -1.29	not detected
SYF2	YGR129W	SLD5	Q03406	294 aa		7	□□□□□ -1.29
SYF2	YGR129W	TY1A-MR1	Q04215	440 aa		7	□□□□□ -1.29
SYF2	YGR129W	NUM1	Q00402	2748 aa		7	□□□□□ -1.29
SYF2	YGR129W	CAD1	P24813	409 aa	Known RBP	6.99	□□□□□ -1.29
SYF2	YGR129W	VPS53	P47061	822 aa		6.99	□□□□□ -1.29
SYF2	YGR129W	YGL039W	P53183	348 aa	Known RBP	6.99	□□□□□ -1.29
SYF2	YGR129W	ISU1	Q03020	165 aa		6.99	□□□□□ -1.29
SYF2	YGR129W	YDR461C-A	Q2V2P7	80 aa		6.99	□□□□□ -1.29
SYF2	YGR129W	SAM1	P10659	382 aa	Known RBP	6.98	□□□□□ -1.29
SYF2	YGR129W	MCM4	P30665	933 aa	Known RBP	6.98	□□□□□ -1.29
SYF2	YGR129W	GPT2	P36148	743 aa		6.98	□□□□□ -1.29
SYF2	YGR129W	GEF1	P37020	779 aa		6.98	□□□□□ -1.29
SYF2	YGR129W	RDH54	P38086	958 aa		6.98	□□□□□ -1.29
SYF2	YGR129W	LAM4	P38800	1345 aa		6.98	□□□□□ -1.29
SYF2	YGR129W	PHR1	P05066	565 aa	Known RBP RIP-Chip data	6.97	□□□□□ -1.29	not detected
SYF2	YGR129W	TIM23	P32897	222 aa		6.97	□□□□□ -1.29
SYF2	YGR129W	YBL036C	P38197	257 aa		6.97	□□□□□ -1.29
SYF2	YGR129W	POA1	P38218	177 aa		6.97	□□□□□ -1.29
SYF2	YGR129W	SGM1	P47166	707 aa		6.97	□□□□□ -1.29
SYF2	YGR129W	VPS72	Q03388	795 aa		6.97	□□□□□ -1.29
SYF2	YGR129W	ISA1	Q07821	250 aa	Predicted RBP	6.97	□□□□□ -1.29
SYF2	YGR129W	ERP3	Q12403	225 aa		6.97	□□□□□ -1.29
SYF2	YGR129W	TRM11	Q12463	433 aa		6.97	□□□□□ -1.29
SYF2	YGR129W	DAL5	P15365	543 aa		6.96	□□□□□ -1.3
SYF2	YGR129W	SAM2	P19358	384 aa	Known RBP	6.96	□□□□□ -1.3
SYF2	YGR129W	CHS3	P29465	1165 aa		6.96	□□□□□ -1.3
SYF2	YGR129W	ISF1	P32488	338 aa		6.96	□□□□□ -1.3
SYF2	YGR129W	TFC4	P33339	1025 aa		6.96	□□□□□ -1.3
SYF2	YGR129W	SHP1	P34223	423 aa		6.96	□□□□□ -1.3
SYF2	YGR129W	DBP7	P36120	742 aa	Known RBP	6.96	□□□□□ -1.3
SYF2	YGR129W	PHO88	P38264	188 aa	Predicted RBP	6.96	□□□□□ -1.3
SYF2	YGR129W	BRL1	P38770	471 aa		6.96	□□□□□ -1.3
SYF2	YGR129W	DLD3	P39976	496 aa	Known RBP	6.96	□□□□□ -1.3
SYF2	YGR129W	MYO1	P08964	1928 aa		6.95	□□□□□ -1.3
SYF2	YGR129W	CCP1	P00431	361 aa		6.95	□□□□□ -1.3
SYF2	YGR129W	RPP2B	P02400	110 aa	Known RBP	6.95	□□□□□ -1.3
SYF2	YGR129W	SUI2	P20459	304 aa	Known RBP	6.95	□□□□□ -1.3
SYF2	YGR129W	SPT5	P27692	1063 aa	Known RBP	6.95	□□□□□ -1.3
SYF2	YGR129W	TGL1	P34163	548 aa		6.95	□□□□□ -1.3
SYF2	YGR129W	OYE3	P41816	400 aa	Predicted RBP	6.95	□□□□□ -1.3
SYF2	YGR129W	IOC3	P43596	787 aa		6.95	□□□□□ -1.3
SYF2	YGR129W	POL32	P47110	350 aa		6.95	□□□□□ -1.3
SYF2	YGR129W	TMA64	Q04600	565 aa	Known RBP	6.95	□□□□□ -1.3
SYF2	YGR129W	MCM16	Q12262	181 aa		6.95	□□□□□ -1.3
SYF2	YGR129W	IDI1	P15496	288 aa		6.94	□□□□□ -1.3
SYF2	YGR129W	AZR1	P50080	613 aa		6.94	□□□□□ -1.3
SYF2	YGR129W	EMI2	Q04409	500 aa	Known RBP	6.94	□□□□□ -1.3
SYF2	YGR129W	YMR321C	Q04898	105 aa		6.94	□□□□□ -1.3
SYF2	YGR129W	SPH1	Q06160	661 aa		6.94	□□□□□ -1.3
SYF2	YGR129W	MOT1	P32333	1867 aa		6.94	□□□□□ -1.3
SYF2	YGR129W	TKL1	P23254	680 aa	Known RBP	6.93	□□□□□ -1.3
SYF2	YGR129W	DUR3	P33413	735 aa		6.93	□□□□□ -1.3
SYF2	YGR129W	MCR1	P36060	302 aa	Known RBP	6.93	□□□□□ -1.3
SYF2	YGR129W	KTR3	P38130	404 aa	Predicted RBP	6.93	□□□□□ -1.3
SYF2	YGR129W	VID27	P40157	782 aa		6.93	□□□□□ -1.3
SYF2	YGR129W	VTC4	P47075	721 aa		6.93	□□□□□ -1.3
SYF2	YGR129W	TFB3	Q03290	321 aa		6.93	□□□□□ -1.3
SYF2	YGR129W	DUS3	Q06053	668 aa	Known RBP	6.93	□□□□□ -1.3
SYF2	YGR129W	SPT2	P06843	333 aa	Predicted RBP	6.92	□□□□□ -1.3
SYF2	YGR129W	SWI6	P09959	803 aa		6.92	□□□□□ -1.3

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 16.7 ms