Protein–RNA interactions for Protein: Q5K131

CLLU1, Chronic lymphocytic leukemia up-regulated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 121 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLLU1Q5K131 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CLLU1Q5K131 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CLLU1Q5K131 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CLLU1Q5K131 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CLLU1Q5K131 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CLLU1Q5K131 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CLLU1Q5K131 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CLLU1Q5K131 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CLLU1Q5K131 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CLLU1Q5K131 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CLLU1Q5K131 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CLLU1Q5K131 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CLLU1Q5K131 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CLLU1Q5K131 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CLLU1Q5K131 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CLLU1Q5K131 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CLLU1Q5K131 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CLLU1Q5K131 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CLLU1Q5K131 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CLLU1Q5K131 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CLLU1Q5K131 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CLLU1Q5K131 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CLLU1Q5K131 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CLLU1Q5K131 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CLLU1Q5K131 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CLLU1Q5K131 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CLLU1Q5K131 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CLLU1Q5K131 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CLLU1Q5K131 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CLLU1Q5K131 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CLLU1Q5K131 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CLLU1Q5K131 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CLLU1Q5K131 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CLLU1Q5K131 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CLLU1Q5K131 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CLLU1Q5K131 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CLLU1Q5K131 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CLLU1Q5K131 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CLLU1Q5K131 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CLLU1Q5K131 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CLLU1Q5K131 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CLLU1Q5K131 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CLLU1Q5K131 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CLLU1Q5K131 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CLLU1Q5K131 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CLLU1Q5K131 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CLLU1Q5K131 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CLLU1Q5K131 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CLLU1Q5K131 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CLLU1Q5K131 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CLLU1Q5K131 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CLLU1Q5K131 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CLLU1Q5K131 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
CLLU1Q5K131 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CLLU1Q5K131 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CLLU1Q5K131 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CLLU1Q5K131 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CLLU1Q5K131 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CLLU1Q5K131 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CLLU1Q5K131 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CLLU1Q5K131 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLLU1Q5K131 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CLLU1Q5K131 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CLLU1Q5K131 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CLLU1Q5K131 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CLLU1Q5K131 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CLLU1Q5K131 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CLLU1Q5K131 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CLLU1Q5K131 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CLLU1Q5K131 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CLLU1Q5K131 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLLU1Q5K131 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLLU1Q5K131 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLLU1Q5K131 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CLLU1Q5K131 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CLLU1Q5K131 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CLLU1Q5K131 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CLLU1Q5K131 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CLLU1Q5K131 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CLLU1Q5K131 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLLU1Q5K131 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CLLU1Q5K131 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLLU1Q5K131 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CLLU1Q5K131 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CLLU1Q5K131 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLLU1Q5K131 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLLU1Q5K131 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLLU1Q5K131 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CLLU1Q5K131 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CLLU1Q5K131 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLLU1Q5K131 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLLU1Q5K131 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLLU1Q5K131 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLLU1Q5K131 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLLU1Q5K131 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLLU1Q5K131 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLLU1Q5K131 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLLU1Q5K131 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLLU1Q5K131 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLLU1Q5K131 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms