RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000579915.1

PTRH2-204, Transcript of peptidyl-tRNA hydrolase 2, humanhuman

TSL 4

Gene PTRH2, Length 531 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTRH2-204ENST00000579915 CHIC1Q5VXU3 224 aa19.41■□□□□ 0.7
PTRH2-204ENST00000579915 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP19.33■□□□□ 0.68
PTRH2-204ENST00000579915 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP17.06■□□□□ 0.32
PTRH2-204ENST00000579915 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP16.44■□□□□ 0.22
PTRH2-204ENST00000579915 PLPPR3Q6T4P5 718 aa16.03■□□□□ 0.16
PTRH2-204ENST00000579915 FOXD1Q16676 465 aa15.13■□□□□ 0.01
PTRH2-204ENST00000579915 ADRA2BP18089 450 aa14.96□□□□□ -0.01
PTRH2-204ENST00000579915 PPP6R1Q9UPN7 881 aa14.91□□□□□ -0.02
PTRH2-204ENST00000579915 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP14.45□□□□□ -0.1
PTRH2-204ENST00000579915 KCNA4P22459 653 aa14.35□□□□□ -0.11
PTRH2-204ENST00000579915 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa14.15□□□□□ -0.14
PTRH2-204ENST00000579915 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP14.01□□□□□ -0.17
PTRH2-204ENST00000579915 EHMT2Q96KQ7 1210 aa13.98□□□□□ -0.17
PTRH2-204ENST00000579915 MSH5O43196 834 aa13.84□□□□□ -0.19
PTRH2-204ENST00000579915 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP13.81□□□□□ -0.2
PTRH2-204ENST00000579915 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP13.8□□□□□ -0.2
PTRH2-204ENST00000579915 NPM3O75607 178 aaKnown RBP13.7□□□□□ -0.22
PTRH2-204ENST00000579915 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa13.67□□□□□ -0.22
PTRH2-204ENST00000579915 CSRNP3Q8WYN3 585 aa13.52□□□□□ -0.25
PTRH2-204ENST00000579915 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP13.41□□□□□ -0.26
PTRH2-204ENST00000579915 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP13.28□□□□□ -0.28
PTRH2-204ENST00000579915 DNAJC5BQ9UF47 199 aa13.22□□□□□ -0.29
PTRH2-204ENST00000579915 ZBTB22O15209 634 aa13.17□□□□□ -0.3
PTRH2-204ENST00000579915 DMRT2Q9Y5R5 561 aa13.16□□□□□ -0.3
PTRH2-204ENST00000579915 FOXD4L1Q9NU39 408 aa13.11□□□□□ -0.31
PTRH2-204ENST00000579915 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP13.06□□□□□ -0.32
PTRH2-204ENST00000579915 POTEDQ86YR6 584 aa12.93□□□□□ -0.34
PTRH2-204ENST00000579915 SLC4A2P04920 1241 aa12.78□□□□□ -0.36
PTRH2-204ENST00000579915 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP12.7□□□□□ -0.38
PTRH2-204ENST00000579915 DCAF8L1A6NGE4 600 aa12.66□□□□□ -0.38
PTRH2-204ENST00000579915 ATXN8OSP0DMR3 200 aa12.63□□□□□ -0.39
PTRH2-204ENST00000579915 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP12.54□□□□□ -0.49e-6■□□□□ 10.7
PTRH2-204ENST00000579915 NISCHQ9Y2I1 1504 aa12.44□□□□□ -0.42
PTRH2-204ENST00000579915 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP12.43□□□□□ -0.42
PTRH2-204ENST00000579915 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP12.43□□□□□ -0.42
PTRH2-204ENST00000579915 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP12.38□□□□□ -0.43
PTRH2-204ENST00000579915 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP12.31□□□□□ -0.44
PTRH2-204ENST00000579915 FKBP8Q14318 412 aa12.25□□□□□ -0.45
PTRH2-204ENST00000579915 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP12.24□□□□□ -0.45
PTRH2-204ENST00000579915 APLP2Q06481 763 aa12.21□□□□□ -0.45
PTRH2-204ENST00000579915 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP12.07□□□□□ -0.48
PTRH2-204ENST00000579915 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP12.05□□□□□ -0.48
PTRH2-204ENST00000579915 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP11.96□□□□□ -0.49
PTRH2-204ENST00000579915 TRHP20396 242 aaPredicted RBP11.88□□□□□ -0.51
PTRH2-204ENST00000579915 RNF39Q9H2S5 420 aa11.85□□□□□ -0.51
PTRH2-204ENST00000579915 CAPN15O75808 1086 aa11.83□□□□□ -0.52
PTRH2-204ENST00000579915 FBLN2P98095 1184 aa11.83□□□□□ -0.52
PTRH2-204ENST00000579915 ABCC9O60706 1549 aa11.82□□□□□ -0.52
PTRH2-204ENST00000579915 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP11.82□□□□□ -0.52
PTRH2-204ENST00000579915 SPDYE4A6NLX3 237 aa11.79□□□□□ -0.52
PTRH2-204ENST00000579915 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP11.78□□□□□ -0.52
PTRH2-204ENST00000579915 POLA2Q14181 598 aa11.77□□□□□ -0.53
PTRH2-204ENST00000579915 FBXO3Q9UK99 471 aa11.75□□□□□ -0.53
PTRH2-204ENST00000579915 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP11.74□□□□□ -0.53
PTRH2-204ENST00000579915 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP11.68□□□□□ -0.54
PTRH2-204ENST00000579915 SLC24A1O60721 1099 aa11.65□□□□□ -0.54
PTRH2-204ENST00000579915 ABCB7O75027 752 aa11.6□□□□□ -0.55
PTRH2-204ENST00000579915 PROM2Q8N271 834 aa11.59□□□□□ -0.55
PTRH2-204ENST00000579915 VASPP50552 380 aaPredicted RBP11.52□□□□□ -0.57
PTRH2-204ENST00000579915 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP11.5□□□□□ -0.57
PTRH2-204ENST00000579915 DSG3P32926 999 aa11.44□□□□□ -0.58
PTRH2-204ENST00000579915 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa11.41□□□□□ -0.58
PTRH2-204ENST00000579915 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP11.4□□□□□ -0.58
PTRH2-204ENST00000579915 SPDYE2BA6NHP3 402 aa11.36□□□□□ -0.59
PTRH2-204ENST00000579915 SPDYE6P0CI01 402 aa11.36□□□□□ -0.59
PTRH2-204ENST00000579915 SPDYE2Q495Y8 402 aa11.36□□□□□ -0.59
PTRH2-204ENST00000579915 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP11.35□□□□□ -0.59
PTRH2-204ENST00000579915 OSCARQ8IYS5 282 aa11.34□□□□□ -0.59
PTRH2-204ENST00000579915 STAG3Q9UJ98 1225 aa11.29□□□□□ -0.6
PTRH2-204ENST00000579915 KLHL34Q8N239 644 aa11.28□□□□□ -0.6
PTRH2-204ENST00000579915 SSUH2Q9Y2M2 353 aa11.27□□□□□ -0.61
PTRH2-204ENST00000579915 DCAF8L2P0C7V8 631 aa11.24□□□□□ -0.61
PTRH2-204ENST00000579915 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP11.24□□□□□ -0.61
PTRH2-204ENST00000579915 PLCD3Q8N3E9 789 aa11.22□□□□□ -0.61
PTRH2-204ENST00000579915 SPOCK2Q92563 424 aa11.2□□□□□ -0.62
PTRH2-204ENST00000579915 MIER1Q8N108 512 aa11.16□□□□□ -0.62
PTRH2-204ENST00000579915 PKD2Q13563 968 aa11.15□□□□□ -0.62
PTRH2-204ENST00000579915 PLEKHG5O94827 1062 aa11.14□□□□□ -0.63
PTRH2-204ENST00000579915 PLCB2Q00722 1185 aa11.09□□□□□ -0.63
PTRH2-204ENST00000579915 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP11.08□□□□□ -0.64
PTRH2-204ENST00000579915 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP11.07□□□□□ -0.64
PTRH2-204ENST00000579915 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa11.04□□□□□ -0.64
PTRH2-204ENST00000579915 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP10.98□□□□□ -0.65
PTRH2-204ENST00000579915 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP10.97□□□□□ -0.65
PTRH2-204ENST00000579915 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP10.97□□□□□ -0.65
PTRH2-204ENST00000579915 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP10.96□□□□□ -0.65
PTRH2-204ENST00000579915 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP10.93□□□□□ -0.66
PTRH2-204ENST00000579915 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP10.91□□□□□ -0.66
PTRH2-204ENST00000579915 AKT1S1Q96B36 256 aa10.91□□□□□ -0.66
PTRH2-204ENST00000579915 RGL2O15211 777 aa10.89□□□□□ -0.67
PTRH2-204ENST00000579915 TRIM41Q8WV44 630 aa10.89□□□□□ -0.67
PTRH2-204ENST00000579915 UNC13AQ9UPW8 1703 aa10.87□□□□□ -0.67
PTRH2-204ENST00000579915 CLEC11AQ9Y240 323 aa10.85□□□□□ -0.67
PTRH2-204ENST00000579915 GSE1Q14687 1217 aa10.84□□□□□ -0.67
PTRH2-204ENST00000579915 PRR29P0C7W0 189 aa10.83□□□□□ -0.68
PTRH2-204ENST00000579915 NACADO15069 1562 aa10.82□□□□□ -0.68
PTRH2-204ENST00000579915 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP10.81□□□□□ -0.68
PTRH2-204ENST00000579915 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP10.81□□□□□ -0.68
PTRH2-204ENST00000579915 VSIG10Q8N0Z9 540 aa10.8□□□□□ -0.68
PTRH2-204ENST00000579915 CFAP44Q96MT7 982 aa10.8□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.9 ms