Protein–RNA interactions for Protein: A0A1B0GV90

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 55 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A1B0GV90 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
A0A1B0GV90 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
A0A1B0GV90 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
A0A1B0GV90 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
A0A1B0GV90 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
A0A1B0GV90 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
A0A1B0GV90 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
A0A1B0GV90 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
A0A1B0GV90 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
A0A1B0GV90 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
A0A1B0GV90 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
A0A1B0GV90 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
A0A1B0GV90 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
A0A1B0GV90 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
A0A1B0GV90 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
A0A1B0GV90 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
A0A1B0GV90 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
A0A1B0GV90 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
A0A1B0GV90 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
A0A1B0GV90 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
A0A1B0GV90 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
A0A1B0GV90 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
A0A1B0GV90 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
A0A1B0GV90 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
A0A1B0GV90 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
A0A1B0GV90 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
A0A1B0GV90 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
A0A1B0GV90 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
A0A1B0GV90 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
A0A1B0GV90 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
A0A1B0GV90 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
A0A1B0GV90 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
A0A1B0GV90 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
A0A1B0GV90 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.27
A0A1B0GV90 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
A0A1B0GV90 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
A0A1B0GV90 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
A0A1B0GV90 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
A0A1B0GV90 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
A0A1B0GV90 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
A0A1B0GV90 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
A0A1B0GV90 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
A0A1B0GV90 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
A0A1B0GV90 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
A0A1B0GV90 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
A0A1B0GV90 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
A0A1B0GV90 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
A0A1B0GV90 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
A0A1B0GV90 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
A0A1B0GV90 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
A0A1B0GV90 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
A0A1B0GV90 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
A0A1B0GV90 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
A0A1B0GV90 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
A0A1B0GV90 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
A0A1B0GV90 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
A0A1B0GV90 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
A0A1B0GV90 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
A0A1B0GV90 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
A0A1B0GV90 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
A0A1B0GV90 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
A0A1B0GV90 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
A0A1B0GV90 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
A0A1B0GV90 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
A0A1B0GV90 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
A0A1B0GV90 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
A0A1B0GV90 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
A0A1B0GV90 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
A0A1B0GV90 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
A0A1B0GV90 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
A0A1B0GV90 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
A0A1B0GV90 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
A0A1B0GV90 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
A0A1B0GV90 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
A0A1B0GV90 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
A0A1B0GV90 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
A0A1B0GV90 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
A0A1B0GV90 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
A0A1B0GV90 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
A0A1B0GV90 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
A0A1B0GV90 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
A0A1B0GV90 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
A0A1B0GV90 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
A0A1B0GV90 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
A0A1B0GV90 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
A0A1B0GV90 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
A0A1B0GV90 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
A0A1B0GV90 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
A0A1B0GV90 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
A0A1B0GV90 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
A0A1B0GV90 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
A0A1B0GV90 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
A0A1B0GV90 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
A0A1B0GV90 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
A0A1B0GV90 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
A0A1B0GV90 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
A0A1B0GV90 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
A0A1B0GV90 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
A0A1B0GV90 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
A0A1B0GV90 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms