Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6D5

ARFGEF2, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,785 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGEF2Q9Y6D5 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ARFGEF2Q9Y6D5 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ARFGEF2Q9Y6D5 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ARFGEF2Q9Y6D5 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
ARFGEF2Q9Y6D5 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
ARFGEF2Q9Y6D5 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ARFGEF2Q9Y6D5 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ARFGEF2Q9Y6D5 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ARFGEF2Q9Y6D5 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ARFGEF2Q9Y6D5 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
ARFGEF2Q9Y6D5 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ARFGEF2Q9Y6D5 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
ARFGEF2Q9Y6D5 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ARFGEF2Q9Y6D5 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ARFGEF2Q9Y6D5 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
ARFGEF2Q9Y6D5 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
ARFGEF2Q9Y6D5 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ARFGEF2Q9Y6D5 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ARFGEF2Q9Y6D5 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ARFGEF2Q9Y6D5 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ARFGEF2Q9Y6D5 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
ARFGEF2Q9Y6D5 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ARFGEF2Q9Y6D5 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ARFGEF2Q9Y6D5 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ARFGEF2Q9Y6D5 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ARFGEF2Q9Y6D5 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ARFGEF2Q9Y6D5 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ARFGEF2Q9Y6D5 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ARFGEF2Q9Y6D5 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ARFGEF2Q9Y6D5 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ARFGEF2Q9Y6D5 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ARFGEF2Q9Y6D5 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ARFGEF2Q9Y6D5 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ARFGEF2Q9Y6D5 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ARFGEF2Q9Y6D5 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ARFGEF2Q9Y6D5 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ARFGEF2Q9Y6D5 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ARFGEF2Q9Y6D5 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ARFGEF2Q9Y6D5 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ARFGEF2Q9Y6D5 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ARFGEF2Q9Y6D5 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARFGEF2Q9Y6D5 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARFGEF2Q9Y6D5 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARFGEF2Q9Y6D5 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARFGEF2Q9Y6D5 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARFGEF2Q9Y6D5 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARFGEF2Q9Y6D5 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
ARFGEF2Q9Y6D5 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARFGEF2Q9Y6D5 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARFGEF2Q9Y6D5 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARFGEF2Q9Y6D5 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARFGEF2Q9Y6D5 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARFGEF2Q9Y6D5 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARFGEF2Q9Y6D5 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARFGEF2Q9Y6D5 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARFGEF2Q9Y6D5 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ARFGEF2Q9Y6D5 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
ARFGEF2Q9Y6D5 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
ARFGEF2Q9Y6D5 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
ARFGEF2Q9Y6D5 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
ARFGEF2Q9Y6D5 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ARFGEF2Q9Y6D5 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ARFGEF2Q9Y6D5 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ARFGEF2Q9Y6D5 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ARFGEF2Q9Y6D5 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ARFGEF2Q9Y6D5 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ARFGEF2Q9Y6D5 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ARFGEF2Q9Y6D5 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ARFGEF2Q9Y6D5 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ARFGEF2Q9Y6D5 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ARFGEF2Q9Y6D5 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ARFGEF2Q9Y6D5 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ARFGEF2Q9Y6D5 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ARFGEF2Q9Y6D5 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
ARFGEF2Q9Y6D5 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ARFGEF2Q9Y6D5 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
ARFGEF2Q9Y6D5 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ARFGEF2Q9Y6D5 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ARFGEF2Q9Y6D5 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ARFGEF2Q9Y6D5 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ARFGEF2Q9Y6D5 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ARFGEF2Q9Y6D5 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ARFGEF2Q9Y6D5 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
ARFGEF2Q9Y6D5 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ARFGEF2Q9Y6D5 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ARFGEF2Q9Y6D5 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ARFGEF2Q9Y6D5 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ARFGEF2Q9Y6D5 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ARFGEF2Q9Y6D5 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ARFGEF2Q9Y6D5 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
ARFGEF2Q9Y6D5 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ARFGEF2Q9Y6D5 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ARFGEF2Q9Y6D5 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ARFGEF2Q9Y6D5 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ARFGEF2Q9Y6D5 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ARFGEF2Q9Y6D5 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ARFGEF2Q9Y6D5 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ARFGEF2Q9Y6D5 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ARFGEF2Q9Y6D5 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ARFGEF2Q9Y6D5 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms