Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKJ5

CHIC2, Cysteine-rich hydrophobic domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHIC2Q9UKJ5 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CHIC2Q9UKJ5 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CHIC2Q9UKJ5 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CHIC2Q9UKJ5 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
CHIC2Q9UKJ5 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
CHIC2Q9UKJ5 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
CHIC2Q9UKJ5 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
CHIC2Q9UKJ5 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
CHIC2Q9UKJ5 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CHIC2Q9UKJ5 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CHIC2Q9UKJ5 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CHIC2Q9UKJ5 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CHIC2Q9UKJ5 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CHIC2Q9UKJ5 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CHIC2Q9UKJ5 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CHIC2Q9UKJ5 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CHIC2Q9UKJ5 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CHIC2Q9UKJ5 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CHIC2Q9UKJ5 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CHIC2Q9UKJ5 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CHIC2Q9UKJ5 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CHIC2Q9UKJ5 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CHIC2Q9UKJ5 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CHIC2Q9UKJ5 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CHIC2Q9UKJ5 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CHIC2Q9UKJ5 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CHIC2Q9UKJ5 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CHIC2Q9UKJ5 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CHIC2Q9UKJ5 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CHIC2Q9UKJ5 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CHIC2Q9UKJ5 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CHIC2Q9UKJ5 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CHIC2Q9UKJ5 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
CHIC2Q9UKJ5 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CHIC2Q9UKJ5 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CHIC2Q9UKJ5 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CHIC2Q9UKJ5 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CHIC2Q9UKJ5 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CHIC2Q9UKJ5 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CHIC2Q9UKJ5 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CHIC2Q9UKJ5 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CHIC2Q9UKJ5 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CHIC2Q9UKJ5 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CHIC2Q9UKJ5 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
CHIC2Q9UKJ5 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CHIC2Q9UKJ5 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CHIC2Q9UKJ5 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
CHIC2Q9UKJ5 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CHIC2Q9UKJ5 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CHIC2Q9UKJ5 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CHIC2Q9UKJ5 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
CHIC2Q9UKJ5 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
CHIC2Q9UKJ5 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CHIC2Q9UKJ5 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CHIC2Q9UKJ5 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CHIC2Q9UKJ5 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CHIC2Q9UKJ5 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CHIC2Q9UKJ5 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CHIC2Q9UKJ5 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CHIC2Q9UKJ5 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CHIC2Q9UKJ5 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CHIC2Q9UKJ5 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CHIC2Q9UKJ5 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CHIC2Q9UKJ5 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CHIC2Q9UKJ5 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
CHIC2Q9UKJ5 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
CHIC2Q9UKJ5 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CHIC2Q9UKJ5 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CHIC2Q9UKJ5 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CHIC2Q9UKJ5 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CHIC2Q9UKJ5 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CHIC2Q9UKJ5 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CHIC2Q9UKJ5 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CHIC2Q9UKJ5 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CHIC2Q9UKJ5 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CHIC2Q9UKJ5 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CHIC2Q9UKJ5 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CHIC2Q9UKJ5 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CHIC2Q9UKJ5 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CHIC2Q9UKJ5 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CHIC2Q9UKJ5 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CHIC2Q9UKJ5 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CHIC2Q9UKJ5 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
CHIC2Q9UKJ5 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CHIC2Q9UKJ5 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CHIC2Q9UKJ5 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CHIC2Q9UKJ5 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CHIC2Q9UKJ5 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CHIC2Q9UKJ5 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
CHIC2Q9UKJ5 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CHIC2Q9UKJ5 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CHIC2Q9UKJ5 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CHIC2Q9UKJ5 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CHIC2Q9UKJ5 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CHIC2Q9UKJ5 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CHIC2Q9UKJ5 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CHIC2Q9UKJ5 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
CHIC2Q9UKJ5 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
CHIC2Q9UKJ5 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CHIC2Q9UKJ5 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms