Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKA8

RCAN3, Calcipressin-3, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCAN3Q9UKA8 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
RCAN3Q9UKA8 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
RCAN3Q9UKA8 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RCAN3Q9UKA8 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RCAN3Q9UKA8 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RCAN3Q9UKA8 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RCAN3Q9UKA8 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RCAN3Q9UKA8 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RCAN3Q9UKA8 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RCAN3Q9UKA8 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RCAN3Q9UKA8 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RCAN3Q9UKA8 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RCAN3Q9UKA8 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RCAN3Q9UKA8 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RCAN3Q9UKA8 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RCAN3Q9UKA8 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RCAN3Q9UKA8 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RCAN3Q9UKA8 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RCAN3Q9UKA8 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RCAN3Q9UKA8 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
RCAN3Q9UKA8 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RCAN3Q9UKA8 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RCAN3Q9UKA8 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RCAN3Q9UKA8 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RCAN3Q9UKA8 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RCAN3Q9UKA8 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RCAN3Q9UKA8 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RCAN3Q9UKA8 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RCAN3Q9UKA8 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RCAN3Q9UKA8 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RCAN3Q9UKA8 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RCAN3Q9UKA8 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RCAN3Q9UKA8 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RCAN3Q9UKA8 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RCAN3Q9UKA8 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RCAN3Q9UKA8 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RCAN3Q9UKA8 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RCAN3Q9UKA8 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RCAN3Q9UKA8 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RCAN3Q9UKA8 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RCAN3Q9UKA8 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RCAN3Q9UKA8 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RCAN3Q9UKA8 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RCAN3Q9UKA8 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RCAN3Q9UKA8 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RCAN3Q9UKA8 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RCAN3Q9UKA8 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RCAN3Q9UKA8 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RCAN3Q9UKA8 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RCAN3Q9UKA8 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RCAN3Q9UKA8 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RCAN3Q9UKA8 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RCAN3Q9UKA8 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RCAN3Q9UKA8 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RCAN3Q9UKA8 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RCAN3Q9UKA8 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
RCAN3Q9UKA8 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RCAN3Q9UKA8 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RCAN3Q9UKA8 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RCAN3Q9UKA8 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RCAN3Q9UKA8 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RCAN3Q9UKA8 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RCAN3Q9UKA8 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RCAN3Q9UKA8 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RCAN3Q9UKA8 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RCAN3Q9UKA8 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RCAN3Q9UKA8 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
RCAN3Q9UKA8 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
RCAN3Q9UKA8 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
RCAN3Q9UKA8 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RCAN3Q9UKA8 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RCAN3Q9UKA8 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RCAN3Q9UKA8 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RCAN3Q9UKA8 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RCAN3Q9UKA8 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RCAN3Q9UKA8 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RCAN3Q9UKA8 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RCAN3Q9UKA8 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RCAN3Q9UKA8 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RCAN3Q9UKA8 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RCAN3Q9UKA8 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RCAN3Q9UKA8 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RCAN3Q9UKA8 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RCAN3Q9UKA8 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RCAN3Q9UKA8 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RCAN3Q9UKA8 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RCAN3Q9UKA8 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RCAN3Q9UKA8 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RCAN3Q9UKA8 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RCAN3Q9UKA8 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RCAN3Q9UKA8 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
RCAN3Q9UKA8 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
RCAN3Q9UKA8 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RCAN3Q9UKA8 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RCAN3Q9UKA8 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RCAN3Q9UKA8 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RCAN3Q9UKA8 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RCAN3Q9UKA8 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RCAN3Q9UKA8 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RCAN3Q9UKA8 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms