Protein–RNA interactions for Protein: Q9P035

HACD3, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 3, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD3Q9P035 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
HACD3Q9P035 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
HACD3Q9P035 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
HACD3Q9P035 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HACD3Q9P035 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HACD3Q9P035 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HACD3Q9P035 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HACD3Q9P035 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HACD3Q9P035 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HACD3Q9P035 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HACD3Q9P035 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HACD3Q9P035 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HACD3Q9P035 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HACD3Q9P035 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HACD3Q9P035 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HACD3Q9P035 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HACD3Q9P035 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HACD3Q9P035 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HACD3Q9P035 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HACD3Q9P035 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HACD3Q9P035 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HACD3Q9P035 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HACD3Q9P035 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HACD3Q9P035 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HACD3Q9P035 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HACD3Q9P035 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HACD3Q9P035 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HACD3Q9P035 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HACD3Q9P035 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HACD3Q9P035 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HACD3Q9P035 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HACD3Q9P035 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HACD3Q9P035 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
HACD3Q9P035 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HACD3Q9P035 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HACD3Q9P035 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HACD3Q9P035 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HACD3Q9P035 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HACD3Q9P035 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
HACD3Q9P035 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HACD3Q9P035 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HACD3Q9P035 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HACD3Q9P035 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
HACD3Q9P035 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HACD3Q9P035 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HACD3Q9P035 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HACD3Q9P035 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HACD3Q9P035 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
HACD3Q9P035 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HACD3Q9P035 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
HACD3Q9P035 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HACD3Q9P035 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HACD3Q9P035 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HACD3Q9P035 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HACD3Q9P035 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
HACD3Q9P035 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HACD3Q9P035 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
HACD3Q9P035 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC19■□□□□ 0.63
HACD3Q9P035 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HACD3Q9P035 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HACD3Q9P035 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
HACD3Q9P035 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
HACD3Q9P035 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HACD3Q9P035 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
HACD3Q9P035 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
HACD3Q9P035 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HACD3Q9P035 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HACD3Q9P035 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HACD3Q9P035 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HACD3Q9P035 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HACD3Q9P035 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HACD3Q9P035 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HACD3Q9P035 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HACD3Q9P035 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HACD3Q9P035 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HACD3Q9P035 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HACD3Q9P035 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HACD3Q9P035 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HACD3Q9P035 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
HACD3Q9P035 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HACD3Q9P035 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HACD3Q9P035 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HACD3Q9P035 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HACD3Q9P035 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HACD3Q9P035 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HACD3Q9P035 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HACD3Q9P035 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HACD3Q9P035 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HACD3Q9P035 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HACD3Q9P035 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HACD3Q9P035 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HACD3Q9P035 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HACD3Q9P035 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HACD3Q9P035 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HACD3Q9P035 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HACD3Q9P035 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
HACD3Q9P035 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HACD3Q9P035 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HACD3Q9P035 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HACD3Q9P035 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms