Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXJ0

MS4A12, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 12, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A12Q9NXJ0 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MS4A12Q9NXJ0 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MS4A12Q9NXJ0 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
MS4A12Q9NXJ0 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
MS4A12Q9NXJ0 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MS4A12Q9NXJ0 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MS4A12Q9NXJ0 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MS4A12Q9NXJ0 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MS4A12Q9NXJ0 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
MS4A12Q9NXJ0 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
MS4A12Q9NXJ0 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MS4A12Q9NXJ0 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
MS4A12Q9NXJ0 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MS4A12Q9NXJ0 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MS4A12Q9NXJ0 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MS4A12Q9NXJ0 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MS4A12Q9NXJ0 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MS4A12Q9NXJ0 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MS4A12Q9NXJ0 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
MS4A12Q9NXJ0 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MS4A12Q9NXJ0 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MS4A12Q9NXJ0 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MS4A12Q9NXJ0 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MS4A12Q9NXJ0 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MS4A12Q9NXJ0 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MS4A12Q9NXJ0 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
MS4A12Q9NXJ0 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MS4A12Q9NXJ0 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MS4A12Q9NXJ0 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MS4A12Q9NXJ0 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MS4A12Q9NXJ0 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MS4A12Q9NXJ0 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
MS4A12Q9NXJ0 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
MS4A12Q9NXJ0 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MS4A12Q9NXJ0 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MS4A12Q9NXJ0 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MS4A12Q9NXJ0 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MS4A12Q9NXJ0 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
MS4A12Q9NXJ0 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MS4A12Q9NXJ0 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MS4A12Q9NXJ0 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
MS4A12Q9NXJ0 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
MS4A12Q9NXJ0 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MS4A12Q9NXJ0 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
MS4A12Q9NXJ0 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
MS4A12Q9NXJ0 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
MS4A12Q9NXJ0 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MS4A12Q9NXJ0 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MS4A12Q9NXJ0 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MS4A12Q9NXJ0 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
MS4A12Q9NXJ0 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
MS4A12Q9NXJ0 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
MS4A12Q9NXJ0 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MS4A12Q9NXJ0 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
MS4A12Q9NXJ0 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
MS4A12Q9NXJ0 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MS4A12Q9NXJ0 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MS4A12Q9NXJ0 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MS4A12Q9NXJ0 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
MS4A12Q9NXJ0 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
MS4A12Q9NXJ0 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
MS4A12Q9NXJ0 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
MS4A12Q9NXJ0 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MS4A12Q9NXJ0 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MS4A12Q9NXJ0 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MS4A12Q9NXJ0 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MS4A12Q9NXJ0 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MS4A12Q9NXJ0 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MS4A12Q9NXJ0 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
MS4A12Q9NXJ0 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
MS4A12Q9NXJ0 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
MS4A12Q9NXJ0 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MS4A12Q9NXJ0 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
MS4A12Q9NXJ0 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
MS4A12Q9NXJ0 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MS4A12Q9NXJ0 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MS4A12Q9NXJ0 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MS4A12Q9NXJ0 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MS4A12Q9NXJ0 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
MS4A12Q9NXJ0 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
MS4A12Q9NXJ0 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
MS4A12Q9NXJ0 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
MS4A12Q9NXJ0 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
MS4A12Q9NXJ0 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
MS4A12Q9NXJ0 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
MS4A12Q9NXJ0 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
MS4A12Q9NXJ0 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MS4A12Q9NXJ0 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MS4A12Q9NXJ0 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MS4A12Q9NXJ0 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MS4A12Q9NXJ0 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MS4A12Q9NXJ0 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MS4A12Q9NXJ0 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MS4A12Q9NXJ0 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MS4A12Q9NXJ0 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MS4A12Q9NXJ0 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MS4A12Q9NXJ0 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
MS4A12Q9NXJ0 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MS4A12Q9NXJ0 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MS4A12Q9NXJ0 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms