Protein–RNA interactions for Protein: Q9H223

EHD4, EH domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD4Q9H223 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EHD4Q9H223 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EHD4Q9H223 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
EHD4Q9H223 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EHD4Q9H223 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EHD4Q9H223 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EHD4Q9H223 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EHD4Q9H223 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EHD4Q9H223 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EHD4Q9H223 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EHD4Q9H223 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EHD4Q9H223 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EHD4Q9H223 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EHD4Q9H223 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EHD4Q9H223 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EHD4Q9H223 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
EHD4Q9H223 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EHD4Q9H223 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EHD4Q9H223 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
EHD4Q9H223 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EHD4Q9H223 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
EHD4Q9H223 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EHD4Q9H223 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EHD4Q9H223 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EHD4Q9H223 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EHD4Q9H223 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EHD4Q9H223 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EHD4Q9H223 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EHD4Q9H223 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EHD4Q9H223 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EHD4Q9H223 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EHD4Q9H223 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EHD4Q9H223 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EHD4Q9H223 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
EHD4Q9H223 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EHD4Q9H223 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
EHD4Q9H223 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EHD4Q9H223 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EHD4Q9H223 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EHD4Q9H223 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EHD4Q9H223 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EHD4Q9H223 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EHD4Q9H223 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EHD4Q9H223 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EHD4Q9H223 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
EHD4Q9H223 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EHD4Q9H223 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EHD4Q9H223 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EHD4Q9H223 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EHD4Q9H223 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EHD4Q9H223 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EHD4Q9H223 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EHD4Q9H223 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EHD4Q9H223 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EHD4Q9H223 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EHD4Q9H223 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EHD4Q9H223 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EHD4Q9H223 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EHD4Q9H223 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EHD4Q9H223 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EHD4Q9H223 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EHD4Q9H223 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EHD4Q9H223 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EHD4Q9H223 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EHD4Q9H223 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EHD4Q9H223 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
EHD4Q9H223 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EHD4Q9H223 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EHD4Q9H223 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EHD4Q9H223 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EHD4Q9H223 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EHD4Q9H223 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
EHD4Q9H223 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EHD4Q9H223 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EHD4Q9H223 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EHD4Q9H223 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
EHD4Q9H223 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
EHD4Q9H223 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
EHD4Q9H223 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EHD4Q9H223 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EHD4Q9H223 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EHD4Q9H223 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EHD4Q9H223 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EHD4Q9H223 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EHD4Q9H223 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EHD4Q9H223 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EHD4Q9H223 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EHD4Q9H223 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EHD4Q9H223 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EHD4Q9H223 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EHD4Q9H223 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EHD4Q9H223 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EHD4Q9H223 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EHD4Q9H223 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EHD4Q9H223 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EHD4Q9H223 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EHD4Q9H223 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EHD4Q9H223 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EHD4Q9H223 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EHD4Q9H223 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms