Protein–RNA interactions for Protein: Q9H094

NBPF3, Neuroblastoma breakpoint family member 3, humanhuman

Predictions only

Length 633 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF3Q9H094 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NBPF3Q9H094 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NBPF3Q9H094 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NBPF3Q9H094 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
NBPF3Q9H094 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NBPF3Q9H094 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NBPF3Q9H094 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
NBPF3Q9H094 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NBPF3Q9H094 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NBPF3Q9H094 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NBPF3Q9H094 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NBPF3Q9H094 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NBPF3Q9H094 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
NBPF3Q9H094 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NBPF3Q9H094 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NBPF3Q9H094 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NBPF3Q9H094 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NBPF3Q9H094 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NBPF3Q9H094 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NBPF3Q9H094 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NBPF3Q9H094 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NBPF3Q9H094 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NBPF3Q9H094 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NBPF3Q9H094 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NBPF3Q9H094 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NBPF3Q9H094 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NBPF3Q9H094 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NBPF3Q9H094 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
NBPF3Q9H094 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NBPF3Q9H094 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NBPF3Q9H094 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NBPF3Q9H094 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NBPF3Q9H094 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NBPF3Q9H094 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NBPF3Q9H094 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NBPF3Q9H094 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NBPF3Q9H094 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NBPF3Q9H094 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NBPF3Q9H094 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NBPF3Q9H094 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NBPF3Q9H094 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NBPF3Q9H094 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NBPF3Q9H094 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NBPF3Q9H094 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NBPF3Q9H094 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NBPF3Q9H094 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NBPF3Q9H094 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NBPF3Q9H094 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NBPF3Q9H094 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NBPF3Q9H094 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NBPF3Q9H094 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NBPF3Q9H094 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NBPF3Q9H094 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NBPF3Q9H094 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NBPF3Q9H094 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NBPF3Q9H094 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NBPF3Q9H094 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NBPF3Q9H094 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NBPF3Q9H094 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NBPF3Q9H094 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NBPF3Q9H094 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NBPF3Q9H094 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NBPF3Q9H094 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NBPF3Q9H094 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NBPF3Q9H094 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NBPF3Q9H094 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
NBPF3Q9H094 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NBPF3Q9H094 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NBPF3Q9H094 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NBPF3Q9H094 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NBPF3Q9H094 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NBPF3Q9H094 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NBPF3Q9H094 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
NBPF3Q9H094 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NBPF3Q9H094 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NBPF3Q9H094 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NBPF3Q9H094 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NBPF3Q9H094 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NBPF3Q9H094 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NBPF3Q9H094 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NBPF3Q9H094 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NBPF3Q9H094 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NBPF3Q9H094 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NBPF3Q9H094 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NBPF3Q9H094 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NBPF3Q9H094 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NBPF3Q9H094 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NBPF3Q9H094 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
NBPF3Q9H094 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NBPF3Q9H094 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NBPF3Q9H094 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NBPF3Q9H094 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NBPF3Q9H094 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NBPF3Q9H094 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NBPF3Q9H094 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NBPF3Q9H094 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NBPF3Q9H094 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NBPF3Q9H094 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NBPF3Q9H094 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NBPF3Q9H094 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms