Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZI7

UPF3B, Regulator of nonsense transcripts 3B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPF3BQ9BZI7 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UPF3BQ9BZI7 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UPF3BQ9BZI7 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UPF3BQ9BZI7 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
UPF3BQ9BZI7 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
UPF3BQ9BZI7 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
UPF3BQ9BZI7 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
UPF3BQ9BZI7 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
UPF3BQ9BZI7 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UPF3BQ9BZI7 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UPF3BQ9BZI7 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
UPF3BQ9BZI7 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
UPF3BQ9BZI7 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
UPF3BQ9BZI7 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
UPF3BQ9BZI7 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
UPF3BQ9BZI7 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UPF3BQ9BZI7 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UPF3BQ9BZI7 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UPF3BQ9BZI7 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UPF3BQ9BZI7 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UPF3BQ9BZI7 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UPF3BQ9BZI7 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UPF3BQ9BZI7 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UPF3BQ9BZI7 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UPF3BQ9BZI7 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
UPF3BQ9BZI7 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UPF3BQ9BZI7 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
UPF3BQ9BZI7 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UPF3BQ9BZI7 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UPF3BQ9BZI7 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
UPF3BQ9BZI7 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
UPF3BQ9BZI7 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UPF3BQ9BZI7 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
UPF3BQ9BZI7 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
UPF3BQ9BZI7 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
UPF3BQ9BZI7 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
UPF3BQ9BZI7 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
UPF3BQ9BZI7 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
UPF3BQ9BZI7 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
UPF3BQ9BZI7 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UPF3BQ9BZI7 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UPF3BQ9BZI7 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UPF3BQ9BZI7 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UPF3BQ9BZI7 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UPF3BQ9BZI7 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UPF3BQ9BZI7 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
UPF3BQ9BZI7 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UPF3BQ9BZI7 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UPF3BQ9BZI7 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
UPF3BQ9BZI7 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UPF3BQ9BZI7 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UPF3BQ9BZI7 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
UPF3BQ9BZI7 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
UPF3BQ9BZI7 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
UPF3BQ9BZI7 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
UPF3BQ9BZI7 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UPF3BQ9BZI7 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
UPF3BQ9BZI7 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
UPF3BQ9BZI7 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
UPF3BQ9BZI7 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
UPF3BQ9BZI7 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
UPF3BQ9BZI7 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
UPF3BQ9BZI7 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
UPF3BQ9BZI7 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
UPF3BQ9BZI7 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
UPF3BQ9BZI7 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
UPF3BQ9BZI7 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
UPF3BQ9BZI7 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
UPF3BQ9BZI7 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
UPF3BQ9BZI7 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
UPF3BQ9BZI7 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
UPF3BQ9BZI7 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
UPF3BQ9BZI7 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
UPF3BQ9BZI7 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
UPF3BQ9BZI7 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
UPF3BQ9BZI7 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
UPF3BQ9BZI7 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
UPF3BQ9BZI7 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
UPF3BQ9BZI7 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
UPF3BQ9BZI7 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
UPF3BQ9BZI7 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
UPF3BQ9BZI7 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
UPF3BQ9BZI7 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
UPF3BQ9BZI7 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
UPF3BQ9BZI7 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
UPF3BQ9BZI7 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
UPF3BQ9BZI7 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
UPF3BQ9BZI7 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
UPF3BQ9BZI7 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
UPF3BQ9BZI7 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
UPF3BQ9BZI7 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
UPF3BQ9BZI7 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UPF3BQ9BZI7 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UPF3BQ9BZI7 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UPF3BQ9BZI7 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UPF3BQ9BZI7 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UPF3BQ9BZI7 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UPF3BQ9BZI7 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UPF3BQ9BZI7 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UPF3BQ9BZI7 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms