Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXA9

SALL3, Sal-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL3Q9BXA9 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SALL3Q9BXA9 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SALL3Q9BXA9 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SALL3Q9BXA9 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SALL3Q9BXA9 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SALL3Q9BXA9 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SALL3Q9BXA9 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SALL3Q9BXA9 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SALL3Q9BXA9 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SALL3Q9BXA9 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SALL3Q9BXA9 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SALL3Q9BXA9 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SALL3Q9BXA9 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SALL3Q9BXA9 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SALL3Q9BXA9 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SALL3Q9BXA9 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SALL3Q9BXA9 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SALL3Q9BXA9 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SALL3Q9BXA9 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SALL3Q9BXA9 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SALL3Q9BXA9 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SALL3Q9BXA9 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SALL3Q9BXA9 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SALL3Q9BXA9 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SALL3Q9BXA9 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SALL3Q9BXA9 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SALL3Q9BXA9 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SALL3Q9BXA9 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SALL3Q9BXA9 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SALL3Q9BXA9 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SALL3Q9BXA9 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SALL3Q9BXA9 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SALL3Q9BXA9 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SALL3Q9BXA9 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SALL3Q9BXA9 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SALL3Q9BXA9 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SALL3Q9BXA9 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SALL3Q9BXA9 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SALL3Q9BXA9 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SALL3Q9BXA9 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SALL3Q9BXA9 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SALL3Q9BXA9 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SALL3Q9BXA9 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SALL3Q9BXA9 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SALL3Q9BXA9 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SALL3Q9BXA9 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SALL3Q9BXA9 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SALL3Q9BXA9 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SALL3Q9BXA9 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SALL3Q9BXA9 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SALL3Q9BXA9 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SALL3Q9BXA9 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SALL3Q9BXA9 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SALL3Q9BXA9 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SALL3Q9BXA9 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SALL3Q9BXA9 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SALL3Q9BXA9 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SALL3Q9BXA9 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SALL3Q9BXA9 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SALL3Q9BXA9 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SALL3Q9BXA9 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SALL3Q9BXA9 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SALL3Q9BXA9 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SALL3Q9BXA9 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SALL3Q9BXA9 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SALL3Q9BXA9 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SALL3Q9BXA9 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SALL3Q9BXA9 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SALL3Q9BXA9 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SALL3Q9BXA9 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SALL3Q9BXA9 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SALL3Q9BXA9 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SALL3Q9BXA9 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SALL3Q9BXA9 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SALL3Q9BXA9 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SALL3Q9BXA9 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SALL3Q9BXA9 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SALL3Q9BXA9 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SALL3Q9BXA9 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SALL3Q9BXA9 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SALL3Q9BXA9 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SALL3Q9BXA9 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SALL3Q9BXA9 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SALL3Q9BXA9 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SALL3Q9BXA9 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SALL3Q9BXA9 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SALL3Q9BXA9 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SALL3Q9BXA9 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SALL3Q9BXA9 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SALL3Q9BXA9 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SALL3Q9BXA9 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SALL3Q9BXA9 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SALL3Q9BXA9 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SALL3Q9BXA9 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SALL3Q9BXA9 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SALL3Q9BXA9 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SALL3Q9BXA9 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SALL3Q9BXA9 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SALL3Q9BXA9 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SALL3Q9BXA9 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms