Protein–RNA interactions for Protein: Q99536

VAT1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAT1Q99536 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VAT1Q99536 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VAT1Q99536 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VAT1Q99536 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VAT1Q99536 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
VAT1Q99536 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VAT1Q99536 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VAT1Q99536 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
VAT1Q99536 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
VAT1Q99536 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
VAT1Q99536 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
VAT1Q99536 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
VAT1Q99536 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
VAT1Q99536 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
VAT1Q99536 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
VAT1Q99536 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
VAT1Q99536 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
VAT1Q99536 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
VAT1Q99536 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
VAT1Q99536 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
VAT1Q99536 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
VAT1Q99536 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
VAT1Q99536 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
VAT1Q99536 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
VAT1Q99536 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
VAT1Q99536 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
VAT1Q99536 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
VAT1Q99536 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
VAT1Q99536 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
VAT1Q99536 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
VAT1Q99536 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
VAT1Q99536 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
VAT1Q99536 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
VAT1Q99536 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
VAT1Q99536 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
VAT1Q99536 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
VAT1Q99536 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
VAT1Q99536 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
VAT1Q99536 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
VAT1Q99536 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
VAT1Q99536 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
VAT1Q99536 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
VAT1Q99536 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VAT1Q99536 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VAT1Q99536 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
VAT1Q99536 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
VAT1Q99536 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
VAT1Q99536 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VAT1Q99536 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VAT1Q99536 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VAT1Q99536 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VAT1Q99536 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
VAT1Q99536 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
VAT1Q99536 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
VAT1Q99536 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VAT1Q99536 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VAT1Q99536 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
VAT1Q99536 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
VAT1Q99536 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VAT1Q99536 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
VAT1Q99536 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
VAT1Q99536 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VAT1Q99536 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VAT1Q99536 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VAT1Q99536 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
VAT1Q99536 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VAT1Q99536 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VAT1Q99536 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
VAT1Q99536 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VAT1Q99536 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
VAT1Q99536 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
VAT1Q99536 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
VAT1Q99536 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
VAT1Q99536 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
VAT1Q99536 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
VAT1Q99536 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
VAT1Q99536 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
VAT1Q99536 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
VAT1Q99536 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
VAT1Q99536 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
VAT1Q99536 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
VAT1Q99536 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
VAT1Q99536 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
VAT1Q99536 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
VAT1Q99536 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
VAT1Q99536 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
VAT1Q99536 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
VAT1Q99536 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
VAT1Q99536 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
VAT1Q99536 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
VAT1Q99536 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
VAT1Q99536 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.65
VAT1Q99536 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
VAT1Q99536 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
VAT1Q99536 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
VAT1Q99536 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
VAT1Q99536 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
VAT1Q99536 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
VAT1Q99536 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
VAT1Q99536 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms