Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q35

ALS2CR12, Amyotrophic lateral sclerosis 2 chromosomal region candidate gene 12 protein, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2CR12Q96Q35 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
ALS2CR12Q96Q35 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ALS2CR12Q96Q35 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ALS2CR12Q96Q35 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ALS2CR12Q96Q35 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ALS2CR12Q96Q35 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ALS2CR12Q96Q35 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ALS2CR12Q96Q35 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ALS2CR12Q96Q35 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ALS2CR12Q96Q35 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
ALS2CR12Q96Q35 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ALS2CR12Q96Q35 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ALS2CR12Q96Q35 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ALS2CR12Q96Q35 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ALS2CR12Q96Q35 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ALS2CR12Q96Q35 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ALS2CR12Q96Q35 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ALS2CR12Q96Q35 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ALS2CR12Q96Q35 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ALS2CR12Q96Q35 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ALS2CR12Q96Q35 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ALS2CR12Q96Q35 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
ALS2CR12Q96Q35 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ALS2CR12Q96Q35 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ALS2CR12Q96Q35 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ALS2CR12Q96Q35 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ALS2CR12Q96Q35 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ALS2CR12Q96Q35 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ALS2CR12Q96Q35 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ALS2CR12Q96Q35 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
ALS2CR12Q96Q35 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ALS2CR12Q96Q35 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ALS2CR12Q96Q35 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ALS2CR12Q96Q35 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ALS2CR12Q96Q35 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ALS2CR12Q96Q35 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ALS2CR12Q96Q35 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ALS2CR12Q96Q35 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ALS2CR12Q96Q35 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ALS2CR12Q96Q35 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ALS2CR12Q96Q35 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ALS2CR12Q96Q35 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ALS2CR12Q96Q35 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ALS2CR12Q96Q35 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ALS2CR12Q96Q35 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ALS2CR12Q96Q35 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ALS2CR12Q96Q35 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ALS2CR12Q96Q35 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ALS2CR12Q96Q35 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ALS2CR12Q96Q35 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ALS2CR12Q96Q35 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ALS2CR12Q96Q35 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ALS2CR12Q96Q35 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ALS2CR12Q96Q35 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ALS2CR12Q96Q35 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ALS2CR12Q96Q35 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ALS2CR12Q96Q35 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
ALS2CR12Q96Q35 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ALS2CR12Q96Q35 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ALS2CR12Q96Q35 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ALS2CR12Q96Q35 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ALS2CR12Q96Q35 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ALS2CR12Q96Q35 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ALS2CR12Q96Q35 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ALS2CR12Q96Q35 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ALS2CR12Q96Q35 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ALS2CR12Q96Q35 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ALS2CR12Q96Q35 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ALS2CR12Q96Q35 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ALS2CR12Q96Q35 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ALS2CR12Q96Q35 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ALS2CR12Q96Q35 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ALS2CR12Q96Q35 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ALS2CR12Q96Q35 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ALS2CR12Q96Q35 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ALS2CR12Q96Q35 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ALS2CR12Q96Q35 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ALS2CR12Q96Q35 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ALS2CR12Q96Q35 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ALS2CR12Q96Q35 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ALS2CR12Q96Q35 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ALS2CR12Q96Q35 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ALS2CR12Q96Q35 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ALS2CR12Q96Q35 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ALS2CR12Q96Q35 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ALS2CR12Q96Q35 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ALS2CR12Q96Q35 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ALS2CR12Q96Q35 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ALS2CR12Q96Q35 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ALS2CR12Q96Q35 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ALS2CR12Q96Q35 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ALS2CR12Q96Q35 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ALS2CR12Q96Q35 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ALS2CR12Q96Q35 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ALS2CR12Q96Q35 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ALS2CR12Q96Q35 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ALS2CR12Q96Q35 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ALS2CR12Q96Q35 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ALS2CR12Q96Q35 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ALS2CR12Q96Q35 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms