Protein–RNA interactions for Protein: Q96P20

NLRP3, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP3Q96P20 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NLRP3Q96P20 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
NLRP3Q96P20 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NLRP3Q96P20 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NLRP3Q96P20 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NLRP3Q96P20 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NLRP3Q96P20 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
NLRP3Q96P20 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NLRP3Q96P20 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NLRP3Q96P20 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NLRP3Q96P20 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NLRP3Q96P20 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NLRP3Q96P20 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NLRP3Q96P20 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NLRP3Q96P20 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NLRP3Q96P20 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NLRP3Q96P20 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NLRP3Q96P20 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NLRP3Q96P20 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NLRP3Q96P20 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NLRP3Q96P20 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NLRP3Q96P20 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
NLRP3Q96P20 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NLRP3Q96P20 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NLRP3Q96P20 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NLRP3Q96P20 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NLRP3Q96P20 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
NLRP3Q96P20 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NLRP3Q96P20 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
NLRP3Q96P20 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NLRP3Q96P20 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NLRP3Q96P20 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NLRP3Q96P20 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NLRP3Q96P20 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NLRP3Q96P20 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NLRP3Q96P20 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NLRP3Q96P20 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NLRP3Q96P20 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NLRP3Q96P20 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
NLRP3Q96P20 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NLRP3Q96P20 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NLRP3Q96P20 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
NLRP3Q96P20 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NLRP3Q96P20 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NLRP3Q96P20 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NLRP3Q96P20 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NLRP3Q96P20 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NLRP3Q96P20 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NLRP3Q96P20 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NLRP3Q96P20 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NLRP3Q96P20 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NLRP3Q96P20 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NLRP3Q96P20 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NLRP3Q96P20 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NLRP3Q96P20 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NLRP3Q96P20 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NLRP3Q96P20 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NLRP3Q96P20 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NLRP3Q96P20 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NLRP3Q96P20 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
NLRP3Q96P20 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NLRP3Q96P20 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
NLRP3Q96P20 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NLRP3Q96P20 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NLRP3Q96P20 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NLRP3Q96P20 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NLRP3Q96P20 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NLRP3Q96P20 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NLRP3Q96P20 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NLRP3Q96P20 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NLRP3Q96P20 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NLRP3Q96P20 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NLRP3Q96P20 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NLRP3Q96P20 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NLRP3Q96P20 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NLRP3Q96P20 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NLRP3Q96P20 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NLRP3Q96P20 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NLRP3Q96P20 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NLRP3Q96P20 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NLRP3Q96P20 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NLRP3Q96P20 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NLRP3Q96P20 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NLRP3Q96P20 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NLRP3Q96P20 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NLRP3Q96P20 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NLRP3Q96P20 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NLRP3Q96P20 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NLRP3Q96P20 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NLRP3Q96P20 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NLRP3Q96P20 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NLRP3Q96P20 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NLRP3Q96P20 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NLRP3Q96P20 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NLRP3Q96P20 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NLRP3Q96P20 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NLRP3Q96P20 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NLRP3Q96P20 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
NLRP3Q96P20 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NLRP3Q96P20 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms