Protein–RNA interactions for Protein: Q96F86

EDC3, Enhancer of mRNA-decapping protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDC3Q96F86 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EDC3Q96F86 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EDC3Q96F86 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EDC3Q96F86 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EDC3Q96F86 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
EDC3Q96F86 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EDC3Q96F86 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EDC3Q96F86 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
EDC3Q96F86 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EDC3Q96F86 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
EDC3Q96F86 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EDC3Q96F86 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EDC3Q96F86 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EDC3Q96F86 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EDC3Q96F86 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EDC3Q96F86 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EDC3Q96F86 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EDC3Q96F86 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EDC3Q96F86 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EDC3Q96F86 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EDC3Q96F86 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
EDC3Q96F86 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EDC3Q96F86 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EDC3Q96F86 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EDC3Q96F86 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EDC3Q96F86 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EDC3Q96F86 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EDC3Q96F86 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
EDC3Q96F86 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EDC3Q96F86 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EDC3Q96F86 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EDC3Q96F86 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EDC3Q96F86 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EDC3Q96F86 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EDC3Q96F86 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EDC3Q96F86 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EDC3Q96F86 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EDC3Q96F86 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EDC3Q96F86 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EDC3Q96F86 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
EDC3Q96F86 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EDC3Q96F86 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EDC3Q96F86 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EDC3Q96F86 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EDC3Q96F86 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EDC3Q96F86 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EDC3Q96F86 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EDC3Q96F86 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EDC3Q96F86 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EDC3Q96F86 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EDC3Q96F86 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EDC3Q96F86 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EDC3Q96F86 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EDC3Q96F86 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EDC3Q96F86 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EDC3Q96F86 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
EDC3Q96F86 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EDC3Q96F86 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EDC3Q96F86 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EDC3Q96F86 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EDC3Q96F86 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
EDC3Q96F86 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EDC3Q96F86 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EDC3Q96F86 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EDC3Q96F86 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EDC3Q96F86 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EDC3Q96F86 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EDC3Q96F86 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EDC3Q96F86 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EDC3Q96F86 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EDC3Q96F86 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EDC3Q96F86 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EDC3Q96F86 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
EDC3Q96F86 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EDC3Q96F86 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EDC3Q96F86 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EDC3Q96F86 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EDC3Q96F86 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EDC3Q96F86 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EDC3Q96F86 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
EDC3Q96F86 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EDC3Q96F86 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EDC3Q96F86 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
EDC3Q96F86 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EDC3Q96F86 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EDC3Q96F86 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EDC3Q96F86 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EDC3Q96F86 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EDC3Q96F86 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
EDC3Q96F86 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
EDC3Q96F86 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EDC3Q96F86 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EDC3Q96F86 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EDC3Q96F86 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EDC3Q96F86 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EDC3Q96F86 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EDC3Q96F86 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EDC3Q96F86 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EDC3Q96F86 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EDC3Q96F86 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms