Protein–RNA interactions for Protein: Q71F56

MED13L, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 13-like, humanhuman

Predictions only

Length 2,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED13LQ71F56 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MED13LQ71F56 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MED13LQ71F56 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MED13LQ71F56 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MED13LQ71F56 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
MED13LQ71F56 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
MED13LQ71F56 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MED13LQ71F56 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
MED13LQ71F56 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MED13LQ71F56 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MED13LQ71F56 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MED13LQ71F56 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MED13LQ71F56 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MED13LQ71F56 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MED13LQ71F56 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MED13LQ71F56 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MED13LQ71F56 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MED13LQ71F56 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MED13LQ71F56 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MED13LQ71F56 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MED13LQ71F56 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MED13LQ71F56 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MED13LQ71F56 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MED13LQ71F56 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MED13LQ71F56 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MED13LQ71F56 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MED13LQ71F56 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MED13LQ71F56 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MED13LQ71F56 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MED13LQ71F56 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MED13LQ71F56 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MED13LQ71F56 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MED13LQ71F56 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MED13LQ71F56 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MED13LQ71F56 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MED13LQ71F56 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
MED13LQ71F56 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MED13LQ71F56 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MED13LQ71F56 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MED13LQ71F56 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MED13LQ71F56 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MED13LQ71F56 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MED13LQ71F56 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MED13LQ71F56 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MED13LQ71F56 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
MED13LQ71F56 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
MED13LQ71F56 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MED13LQ71F56 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MED13LQ71F56 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MED13LQ71F56 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MED13LQ71F56 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MED13LQ71F56 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MED13LQ71F56 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MED13LQ71F56 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MED13LQ71F56 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
MED13LQ71F56 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
MED13LQ71F56 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MED13LQ71F56 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MED13LQ71F56 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
MED13LQ71F56 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MED13LQ71F56 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MED13LQ71F56 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MED13LQ71F56 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MED13LQ71F56 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MED13LQ71F56 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MED13LQ71F56 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
MED13LQ71F56 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MED13LQ71F56 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MED13LQ71F56 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MED13LQ71F56 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MED13LQ71F56 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MED13LQ71F56 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MED13LQ71F56 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MED13LQ71F56 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MED13LQ71F56 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MED13LQ71F56 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MED13LQ71F56 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MED13LQ71F56 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MED13LQ71F56 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MED13LQ71F56 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MED13LQ71F56 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MED13LQ71F56 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
MED13LQ71F56 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.14
MED13LQ71F56 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MED13LQ71F56 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MED13LQ71F56 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MED13LQ71F56 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MED13LQ71F56 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MED13LQ71F56 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MED13LQ71F56 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MED13LQ71F56 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MED13LQ71F56 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MED13LQ71F56 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MED13LQ71F56 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MED13LQ71F56 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MED13LQ71F56 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MED13LQ71F56 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MED13LQ71F56 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MED13LQ71F56 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
MED13LQ71F56 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms