Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q795

Putative viral protein-binding protein C1, humanhuman

Predictions only

Length 121 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6Q795 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Q6Q795 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Q6Q795 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Q6Q795 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Q6Q795 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Q6Q795 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Q6Q795 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Q6Q795 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Q6Q795 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Q6Q795 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Q6Q795 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Q6Q795 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Q6Q795 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Q6Q795 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Q6Q795 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Q6Q795 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Q6Q795 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Q6Q795 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Q6Q795 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Q6Q795 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Q6Q795 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Q6Q795 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Q6Q795 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Q6Q795 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Q6Q795 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Q6Q795 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Q6Q795 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Q6Q795 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Q6Q795 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Q6Q795 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Q6Q795 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q6Q795 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q6Q795 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q6Q795 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q6Q795 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q6Q795 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q6Q795 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q6Q795 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q6Q795 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q6Q795 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q6Q795 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q6Q795 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q6Q795 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q6Q795 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Q6Q795 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q6Q795 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q6Q795 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Q6Q795 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q6Q795 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q6Q795 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q6Q795 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q6Q795 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Q6Q795 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q6Q795 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q6Q795 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q6Q795 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q6Q795 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q6Q795 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q6Q795 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q6Q795 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q6Q795 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q6Q795 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q6Q795 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q6Q795 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q6Q795 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q6Q795 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q6Q795 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q6Q795 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q6Q795 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Q6Q795 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q6Q795 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Q6Q795 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Q6Q795 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Q6Q795 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Q6Q795 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Q6Q795 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Q6Q795 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Q6Q795 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Q6Q795 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Q6Q795 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Q6Q795 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Q6Q795 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Q6Q795 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Q6Q795 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Q6Q795 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Q6Q795 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Q6Q795 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Q6Q795 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Q6Q795 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Q6Q795 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Q6Q795 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Q6Q795 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Q6Q795 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Q6Q795 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Q6Q795 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Q6Q795 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Q6Q795 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Q6Q795 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Q6Q795 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Q6Q795 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
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