Protein–RNA interactions for Protein: Q6NT76

HMBOX1, Homeobox-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMBOX1Q6NT76 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HMBOX1Q6NT76 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HMBOX1Q6NT76 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HMBOX1Q6NT76 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HMBOX1Q6NT76 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HMBOX1Q6NT76 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HMBOX1Q6NT76 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HMBOX1Q6NT76 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HMBOX1Q6NT76 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HMBOX1Q6NT76 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HMBOX1Q6NT76 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HMBOX1Q6NT76 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HMBOX1Q6NT76 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HMBOX1Q6NT76 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HMBOX1Q6NT76 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HMBOX1Q6NT76 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HMBOX1Q6NT76 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HMBOX1Q6NT76 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HMBOX1Q6NT76 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HMBOX1Q6NT76 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HMBOX1Q6NT76 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HMBOX1Q6NT76 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HMBOX1Q6NT76 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HMBOX1Q6NT76 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HMBOX1Q6NT76 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HMBOX1Q6NT76 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HMBOX1Q6NT76 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HMBOX1Q6NT76 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HMBOX1Q6NT76 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HMBOX1Q6NT76 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HMBOX1Q6NT76 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HMBOX1Q6NT76 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HMBOX1Q6NT76 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HMBOX1Q6NT76 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HMBOX1Q6NT76 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HMBOX1Q6NT76 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HMBOX1Q6NT76 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HMBOX1Q6NT76 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HMBOX1Q6NT76 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HMBOX1Q6NT76 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HMBOX1Q6NT76 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HMBOX1Q6NT76 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HMBOX1Q6NT76 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HMBOX1Q6NT76 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HMBOX1Q6NT76 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HMBOX1Q6NT76 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HMBOX1Q6NT76 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HMBOX1Q6NT76 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
HMBOX1Q6NT76 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HMBOX1Q6NT76 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HMBOX1Q6NT76 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HMBOX1Q6NT76 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HMBOX1Q6NT76 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HMBOX1Q6NT76 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HMBOX1Q6NT76 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HMBOX1Q6NT76 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HMBOX1Q6NT76 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HMBOX1Q6NT76 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HMBOX1Q6NT76 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HMBOX1Q6NT76 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HMBOX1Q6NT76 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HMBOX1Q6NT76 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HMBOX1Q6NT76 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HMBOX1Q6NT76 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HMBOX1Q6NT76 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HMBOX1Q6NT76 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HMBOX1Q6NT76 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HMBOX1Q6NT76 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HMBOX1Q6NT76 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HMBOX1Q6NT76 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
HMBOX1Q6NT76 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HMBOX1Q6NT76 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HMBOX1Q6NT76 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HMBOX1Q6NT76 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HMBOX1Q6NT76 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HMBOX1Q6NT76 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HMBOX1Q6NT76 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HMBOX1Q6NT76 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HMBOX1Q6NT76 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
HMBOX1Q6NT76 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HMBOX1Q6NT76 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HMBOX1Q6NT76 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HMBOX1Q6NT76 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HMBOX1Q6NT76 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HMBOX1Q6NT76 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HMBOX1Q6NT76 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HMBOX1Q6NT76 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HMBOX1Q6NT76 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HMBOX1Q6NT76 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HMBOX1Q6NT76 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HMBOX1Q6NT76 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HMBOX1Q6NT76 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HMBOX1Q6NT76 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HMBOX1Q6NT76 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HMBOX1Q6NT76 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HMBOX1Q6NT76 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HMBOX1Q6NT76 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HMBOX1Q6NT76 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HMBOX1Q6NT76 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
HMBOX1Q6NT76 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68 ms