Protein–RNA interactions for Protein: Q16695

HIST3H3, Histone H3.1t, humanhuman

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIST3H3Q16695 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HIST3H3Q16695 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
HIST3H3Q16695 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HIST3H3Q16695 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HIST3H3Q16695 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HIST3H3Q16695 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HIST3H3Q16695 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HIST3H3Q16695 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HIST3H3Q16695 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HIST3H3Q16695 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HIST3H3Q16695 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HIST3H3Q16695 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HIST3H3Q16695 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HIST3H3Q16695 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HIST3H3Q16695 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HIST3H3Q16695 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HIST3H3Q16695 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HIST3H3Q16695 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HIST3H3Q16695 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HIST3H3Q16695 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HIST3H3Q16695 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HIST3H3Q16695 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HIST3H3Q16695 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
HIST3H3Q16695 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HIST3H3Q16695 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HIST3H3Q16695 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HIST3H3Q16695 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HIST3H3Q16695 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HIST3H3Q16695 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HIST3H3Q16695 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HIST3H3Q16695 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HIST3H3Q16695 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HIST3H3Q16695 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
HIST3H3Q16695 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HIST3H3Q16695 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HIST3H3Q16695 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HIST3H3Q16695 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HIST3H3Q16695 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HIST3H3Q16695 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HIST3H3Q16695 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HIST3H3Q16695 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HIST3H3Q16695 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HIST3H3Q16695 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HIST3H3Q16695 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HIST3H3Q16695 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HIST3H3Q16695 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HIST3H3Q16695 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HIST3H3Q16695 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HIST3H3Q16695 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HIST3H3Q16695 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HIST3H3Q16695 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HIST3H3Q16695 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HIST3H3Q16695 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HIST3H3Q16695 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HIST3H3Q16695 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HIST3H3Q16695 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HIST3H3Q16695 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HIST3H3Q16695 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HIST3H3Q16695 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
HIST3H3Q16695 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HIST3H3Q16695 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HIST3H3Q16695 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HIST3H3Q16695 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HIST3H3Q16695 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HIST3H3Q16695 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HIST3H3Q16695 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HIST3H3Q16695 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HIST3H3Q16695 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HIST3H3Q16695 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HIST3H3Q16695 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
HIST3H3Q16695 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HIST3H3Q16695 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HIST3H3Q16695 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
HIST3H3Q16695 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HIST3H3Q16695 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HIST3H3Q16695 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HIST3H3Q16695 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HIST3H3Q16695 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HIST3H3Q16695 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HIST3H3Q16695 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HIST3H3Q16695 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HIST3H3Q16695 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HIST3H3Q16695 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HIST3H3Q16695 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HIST3H3Q16695 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HIST3H3Q16695 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HIST3H3Q16695 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
HIST3H3Q16695 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HIST3H3Q16695 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HIST3H3Q16695 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HIST3H3Q16695 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HIST3H3Q16695 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HIST3H3Q16695 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
HIST3H3Q16695 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HIST3H3Q16695 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HIST3H3Q16695 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HIST3H3Q16695 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
HIST3H3Q16695 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
HIST3H3Q16695 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HIST3H3Q16695 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms