Protein–RNA interactions for Protein: Q15256

PTPRR, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRRQ15256 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PTPRRQ15256 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PTPRRQ15256 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPRRQ15256 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPRRQ15256 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPRRQ15256 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPRRQ15256 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPRRQ15256 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPRRQ15256 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPRRQ15256 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPRRQ15256 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPRRQ15256 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPRRQ15256 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPRRQ15256 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPRRQ15256 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPRRQ15256 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPRRQ15256 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPRRQ15256 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPRRQ15256 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPRRQ15256 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPRRQ15256 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPRRQ15256 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPRRQ15256 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPRRQ15256 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPRRQ15256 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPRRQ15256 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPRRQ15256 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPRRQ15256 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPRRQ15256 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPRRQ15256 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPRRQ15256 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPRRQ15256 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPRRQ15256 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPRRQ15256 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPRRQ15256 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPRRQ15256 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPRRQ15256 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPRRQ15256 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPRRQ15256 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPRRQ15256 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPRRQ15256 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPRRQ15256 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPRRQ15256 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPRRQ15256 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPRRQ15256 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPRRQ15256 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPRRQ15256 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPRRQ15256 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPRRQ15256 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPRRQ15256 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPRRQ15256 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPRRQ15256 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPRRQ15256 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPRRQ15256 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPRRQ15256 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPRRQ15256 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPRRQ15256 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPRRQ15256 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPRRQ15256 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPRRQ15256 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPRRQ15256 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPRRQ15256 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPRRQ15256 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPRRQ15256 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPRRQ15256 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPRRQ15256 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPRRQ15256 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPRRQ15256 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPRRQ15256 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPRRQ15256 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPRRQ15256 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPRRQ15256 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPRRQ15256 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPRRQ15256 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPRRQ15256 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPRRQ15256 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPRRQ15256 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPRRQ15256 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPRRQ15256 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPRRQ15256 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPRRQ15256 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPRRQ15256 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPRRQ15256 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPRRQ15256 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPRRQ15256 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPRRQ15256 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPRRQ15256 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPRRQ15256 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPRRQ15256 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPRRQ15256 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPRRQ15256 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPRRQ15256 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPRRQ15256 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPRRQ15256 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPRRQ15256 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPRRQ15256 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPRRQ15256 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPRRQ15256 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPRRQ15256 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPRRQ15256 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.4 ms