Protein–RNA interactions for Protein: Q13972

RASGRF1, Ras-specific guanine nucleotide-releasing factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGRF1Q13972 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RASGRF1Q13972 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RASGRF1Q13972 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RASGRF1Q13972 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RASGRF1Q13972 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RASGRF1Q13972 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RASGRF1Q13972 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RASGRF1Q13972 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RASGRF1Q13972 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RASGRF1Q13972 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
RASGRF1Q13972 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RASGRF1Q13972 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RASGRF1Q13972 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
RASGRF1Q13972 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
RASGRF1Q13972 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RASGRF1Q13972 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RASGRF1Q13972 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RASGRF1Q13972 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RASGRF1Q13972 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RASGRF1Q13972 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RASGRF1Q13972 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RASGRF1Q13972 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RASGRF1Q13972 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RASGRF1Q13972 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RASGRF1Q13972 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RASGRF1Q13972 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
RASGRF1Q13972 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RASGRF1Q13972 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RASGRF1Q13972 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RASGRF1Q13972 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RASGRF1Q13972 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RASGRF1Q13972 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RASGRF1Q13972 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
RASGRF1Q13972 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RASGRF1Q13972 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
RASGRF1Q13972 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RASGRF1Q13972 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RASGRF1Q13972 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RASGRF1Q13972 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RASGRF1Q13972 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RASGRF1Q13972 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RASGRF1Q13972 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
RASGRF1Q13972 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RASGRF1Q13972 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RASGRF1Q13972 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RASGRF1Q13972 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RASGRF1Q13972 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
RASGRF1Q13972 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
RASGRF1Q13972 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
RASGRF1Q13972 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RASGRF1Q13972 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RASGRF1Q13972 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RASGRF1Q13972 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RASGRF1Q13972 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RASGRF1Q13972 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RASGRF1Q13972 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RASGRF1Q13972 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RASGRF1Q13972 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
RASGRF1Q13972 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RASGRF1Q13972 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RASGRF1Q13972 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RASGRF1Q13972 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RASGRF1Q13972 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RASGRF1Q13972 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RASGRF1Q13972 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RASGRF1Q13972 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RASGRF1Q13972 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RASGRF1Q13972 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
RASGRF1Q13972 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RASGRF1Q13972 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RASGRF1Q13972 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RASGRF1Q13972 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RASGRF1Q13972 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RASGRF1Q13972 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RASGRF1Q13972 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RASGRF1Q13972 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RASGRF1Q13972 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RASGRF1Q13972 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RASGRF1Q13972 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RASGRF1Q13972 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RASGRF1Q13972 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RASGRF1Q13972 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RASGRF1Q13972 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
RASGRF1Q13972 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RASGRF1Q13972 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RASGRF1Q13972 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RASGRF1Q13972 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RASGRF1Q13972 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RASGRF1Q13972 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RASGRF1Q13972 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RASGRF1Q13972 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RASGRF1Q13972 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RASGRF1Q13972 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RASGRF1Q13972 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RASGRF1Q13972 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RASGRF1Q13972 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RASGRF1Q13972 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RASGRF1Q13972 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RASGRF1Q13972 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
RASGRF1Q13972 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.2 ms