Protein–RNA interactions for Protein: Q13137

CALCOCO2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO2Q13137 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CALCOCO2Q13137 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CALCOCO2Q13137 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
CALCOCO2Q13137 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CALCOCO2Q13137 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CALCOCO2Q13137 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
CALCOCO2Q13137 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CALCOCO2Q13137 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CALCOCO2Q13137 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CALCOCO2Q13137 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CALCOCO2Q13137 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
CALCOCO2Q13137 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
CALCOCO2Q13137 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CALCOCO2Q13137 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CALCOCO2Q13137 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CALCOCO2Q13137 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CALCOCO2Q13137 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
CALCOCO2Q13137 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CALCOCO2Q13137 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CALCOCO2Q13137 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CALCOCO2Q13137 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CALCOCO2Q13137 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CALCOCO2Q13137 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CALCOCO2Q13137 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CALCOCO2Q13137 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CALCOCO2Q13137 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CALCOCO2Q13137 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CALCOCO2Q13137 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CALCOCO2Q13137 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CALCOCO2Q13137 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CALCOCO2Q13137 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CALCOCO2Q13137 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CALCOCO2Q13137 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CALCOCO2Q13137 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CALCOCO2Q13137 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CALCOCO2Q13137 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CALCOCO2Q13137 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CALCOCO2Q13137 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CALCOCO2Q13137 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CALCOCO2Q13137 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
CALCOCO2Q13137 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CALCOCO2Q13137 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CALCOCO2Q13137 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CALCOCO2Q13137 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CALCOCO2Q13137 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CALCOCO2Q13137 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CALCOCO2Q13137 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CALCOCO2Q13137 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CALCOCO2Q13137 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CALCOCO2Q13137 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CALCOCO2Q13137 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CALCOCO2Q13137 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CALCOCO2Q13137 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CALCOCO2Q13137 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CALCOCO2Q13137 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CALCOCO2Q13137 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CALCOCO2Q13137 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CALCOCO2Q13137 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CALCOCO2Q13137 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CALCOCO2Q13137 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CALCOCO2Q13137 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CALCOCO2Q13137 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
CALCOCO2Q13137 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CALCOCO2Q13137 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CALCOCO2Q13137 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CALCOCO2Q13137 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CALCOCO2Q13137 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CALCOCO2Q13137 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CALCOCO2Q13137 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
CALCOCO2Q13137 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CALCOCO2Q13137 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
CALCOCO2Q13137 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
CALCOCO2Q13137 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CALCOCO2Q13137 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
CALCOCO2Q13137 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CALCOCO2Q13137 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CALCOCO2Q13137 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CALCOCO2Q13137 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CALCOCO2Q13137 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CALCOCO2Q13137 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CALCOCO2Q13137 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CALCOCO2Q13137 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CALCOCO2Q13137 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CALCOCO2Q13137 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CALCOCO2Q13137 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CALCOCO2Q13137 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CALCOCO2Q13137 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CALCOCO2Q13137 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CALCOCO2Q13137 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CALCOCO2Q13137 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CALCOCO2Q13137 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CALCOCO2Q13137 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CALCOCO2Q13137 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CALCOCO2Q13137 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CALCOCO2Q13137 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CALCOCO2Q13137 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CALCOCO2Q13137 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CALCOCO2Q13137 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CALCOCO2Q13137 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CALCOCO2Q13137 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms