Protein–RNA interactions for Protein: Q00444

HOXC5, Homeobox protein Hox-C5, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC5Q00444 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXC5Q00444 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXC5Q00444 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXC5Q00444 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXC5Q00444 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXC5Q00444 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXC5Q00444 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXC5Q00444 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXC5Q00444 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXC5Q00444 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXC5Q00444 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXC5Q00444 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXC5Q00444 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXC5Q00444 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXC5Q00444 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXC5Q00444 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXC5Q00444 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXC5Q00444 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXC5Q00444 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXC5Q00444 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXC5Q00444 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXC5Q00444 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXC5Q00444 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXC5Q00444 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXC5Q00444 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXC5Q00444 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXC5Q00444 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXC5Q00444 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXC5Q00444 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXC5Q00444 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXC5Q00444 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXC5Q00444 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXC5Q00444 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXC5Q00444 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXC5Q00444 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXC5Q00444 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXC5Q00444 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXC5Q00444 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXC5Q00444 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXC5Q00444 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXC5Q00444 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXC5Q00444 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXC5Q00444 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXC5Q00444 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXC5Q00444 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXC5Q00444 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXC5Q00444 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXC5Q00444 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXC5Q00444 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXC5Q00444 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXC5Q00444 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXC5Q00444 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXC5Q00444 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXC5Q00444 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXC5Q00444 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXC5Q00444 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXC5Q00444 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXC5Q00444 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXC5Q00444 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXC5Q00444 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXC5Q00444 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXC5Q00444 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXC5Q00444 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXC5Q00444 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXC5Q00444 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXC5Q00444 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXC5Q00444 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXC5Q00444 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXC5Q00444 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXC5Q00444 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXC5Q00444 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXC5Q00444 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXC5Q00444 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXC5Q00444 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXC5Q00444 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXC5Q00444 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXC5Q00444 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXC5Q00444 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXC5Q00444 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXC5Q00444 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXC5Q00444 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXC5Q00444 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXC5Q00444 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXC5Q00444 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXC5Q00444 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXC5Q00444 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXC5Q00444 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXC5Q00444 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXC5Q00444 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXC5Q00444 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXC5Q00444 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXC5Q00444 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXC5Q00444 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXC5Q00444 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXC5Q00444 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXC5Q00444 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXC5Q00444 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXC5Q00444 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXC5Q00444 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXC5Q00444 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms