Protein–RNA interactions for Protein: P98174

FGD1, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD1P98174 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FGD1P98174 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FGD1P98174 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FGD1P98174 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FGD1P98174 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
FGD1P98174 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FGD1P98174 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FGD1P98174 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FGD1P98174 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
FGD1P98174 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FGD1P98174 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FGD1P98174 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
FGD1P98174 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FGD1P98174 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FGD1P98174 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FGD1P98174 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FGD1P98174 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FGD1P98174 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FGD1P98174 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FGD1P98174 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FGD1P98174 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FGD1P98174 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FGD1P98174 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FGD1P98174 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FGD1P98174 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FGD1P98174 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FGD1P98174 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FGD1P98174 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FGD1P98174 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FGD1P98174 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FGD1P98174 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FGD1P98174 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FGD1P98174 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FGD1P98174 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FGD1P98174 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FGD1P98174 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
FGD1P98174 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
FGD1P98174 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FGD1P98174 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FGD1P98174 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FGD1P98174 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FGD1P98174 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FGD1P98174 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FGD1P98174 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FGD1P98174 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FGD1P98174 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FGD1P98174 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FGD1P98174 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FGD1P98174 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FGD1P98174 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FGD1P98174 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FGD1P98174 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FGD1P98174 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
FGD1P98174 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FGD1P98174 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FGD1P98174 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FGD1P98174 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FGD1P98174 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
FGD1P98174 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FGD1P98174 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FGD1P98174 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FGD1P98174 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
FGD1P98174 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
FGD1P98174 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
FGD1P98174 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FGD1P98174 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FGD1P98174 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FGD1P98174 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FGD1P98174 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FGD1P98174 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FGD1P98174 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FGD1P98174 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FGD1P98174 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FGD1P98174 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FGD1P98174 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FGD1P98174 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FGD1P98174 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FGD1P98174 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FGD1P98174 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FGD1P98174 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FGD1P98174 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FGD1P98174 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FGD1P98174 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FGD1P98174 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FGD1P98174 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FGD1P98174 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FGD1P98174 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FGD1P98174 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FGD1P98174 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FGD1P98174 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FGD1P98174 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FGD1P98174 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FGD1P98174 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FGD1P98174 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FGD1P98174 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FGD1P98174 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FGD1P98174 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
FGD1P98174 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FGD1P98174 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FGD1P98174 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms