Protein–RNA interactions for Protein: P57773

GJA9, Gap junction alpha-9 protein, humanhuman

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA9P57773 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
GJA9P57773 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
GJA9P57773 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
GJA9P57773 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
GJA9P57773 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
GJA9P57773 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
GJA9P57773 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
GJA9P57773 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
GJA9P57773 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
GJA9P57773 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
GJA9P57773 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
GJA9P57773 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
GJA9P57773 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
GJA9P57773 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
GJA9P57773 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
GJA9P57773 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
GJA9P57773 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
GJA9P57773 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
GJA9P57773 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
GJA9P57773 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
GJA9P57773 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
GJA9P57773 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
GJA9P57773 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
GJA9P57773 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
GJA9P57773 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GJA9P57773 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GJA9P57773 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GJA9P57773 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
GJA9P57773 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GJA9P57773 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
GJA9P57773 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GJA9P57773 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GJA9P57773 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GJA9P57773 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GJA9P57773 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GJA9P57773 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GJA9P57773 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GJA9P57773 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GJA9P57773 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GJA9P57773 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GJA9P57773 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GJA9P57773 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GJA9P57773 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GJA9P57773 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GJA9P57773 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
GJA9P57773 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GJA9P57773 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GJA9P57773 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
GJA9P57773 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GJA9P57773 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GJA9P57773 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GJA9P57773 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GJA9P57773 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GJA9P57773 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GJA9P57773 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GJA9P57773 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GJA9P57773 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GJA9P57773 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GJA9P57773 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GJA9P57773 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GJA9P57773 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GJA9P57773 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GJA9P57773 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GJA9P57773 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GJA9P57773 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GJA9P57773 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GJA9P57773 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GJA9P57773 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GJA9P57773 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GJA9P57773 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GJA9P57773 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
GJA9P57773 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GJA9P57773 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GJA9P57773 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GJA9P57773 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
GJA9P57773 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
GJA9P57773 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GJA9P57773 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GJA9P57773 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GJA9P57773 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
GJA9P57773 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GJA9P57773 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GJA9P57773 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GJA9P57773 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GJA9P57773 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GJA9P57773 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GJA9P57773 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GJA9P57773 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GJA9P57773 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GJA9P57773 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GJA9P57773 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GJA9P57773 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
GJA9P57773 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
GJA9P57773 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GJA9P57773 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
GJA9P57773 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
GJA9P57773 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
GJA9P57773 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GJA9P57773 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GJA9P57773 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms