Protein–RNA interactions for Protein: P55211

CASP9, Caspase-9, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP9P55211 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CASP9P55211 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CASP9P55211 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CASP9P55211 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CASP9P55211 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CASP9P55211 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CASP9P55211 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CASP9P55211 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CASP9P55211 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CASP9P55211 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CASP9P55211 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CASP9P55211 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CASP9P55211 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CASP9P55211 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CASP9P55211 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CASP9P55211 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CASP9P55211 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CASP9P55211 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CASP9P55211 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CASP9P55211 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CASP9P55211 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CASP9P55211 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CASP9P55211 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CASP9P55211 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CASP9P55211 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CASP9P55211 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CASP9P55211 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CASP9P55211 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CASP9P55211 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CASP9P55211 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CASP9P55211 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CASP9P55211 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CASP9P55211 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CASP9P55211 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CASP9P55211 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CASP9P55211 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CASP9P55211 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CASP9P55211 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CASP9P55211 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CASP9P55211 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CASP9P55211 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CASP9P55211 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CASP9P55211 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CASP9P55211 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CASP9P55211 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CASP9P55211 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CASP9P55211 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CASP9P55211 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CASP9P55211 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CASP9P55211 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CASP9P55211 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CASP9P55211 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CASP9P55211 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CASP9P55211 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CASP9P55211 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CASP9P55211 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CASP9P55211 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CASP9P55211 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CASP9P55211 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CASP9P55211 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CASP9P55211 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CASP9P55211 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CASP9P55211 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CASP9P55211 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CASP9P55211 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CASP9P55211 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CASP9P55211 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CASP9P55211 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CASP9P55211 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CASP9P55211 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CASP9P55211 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CASP9P55211 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CASP9P55211 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CASP9P55211 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CASP9P55211 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CASP9P55211 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CASP9P55211 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CASP9P55211 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CASP9P55211 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CASP9P55211 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CASP9P55211 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CASP9P55211 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CASP9P55211 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CASP9P55211 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CASP9P55211 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CASP9P55211 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CASP9P55211 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CASP9P55211 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CASP9P55211 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CASP9P55211 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CASP9P55211 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CASP9P55211 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CASP9P55211 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CASP9P55211 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CASP9P55211 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CASP9P55211 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CASP9P55211 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CASP9P55211 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CASP9P55211 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CASP9P55211 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.5 ms