Protein–RNA interactions for Protein: P51878

CASP5, Caspase-5, humanhuman

Predictions only

Length 434 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP5P51878 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CASP5P51878 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CASP5P51878 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CASP5P51878 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CASP5P51878 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CASP5P51878 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CASP5P51878 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CASP5P51878 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
CASP5P51878 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CASP5P51878 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
CASP5P51878 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CASP5P51878 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CASP5P51878 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CASP5P51878 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
CASP5P51878 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
CASP5P51878 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CASP5P51878 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CASP5P51878 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CASP5P51878 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CASP5P51878 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CASP5P51878 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CASP5P51878 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CASP5P51878 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CASP5P51878 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CASP5P51878 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CASP5P51878 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CASP5P51878 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CASP5P51878 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
CASP5P51878 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CASP5P51878 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CASP5P51878 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CASP5P51878 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CASP5P51878 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CASP5P51878 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CASP5P51878 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CASP5P51878 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CASP5P51878 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CASP5P51878 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CASP5P51878 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CASP5P51878 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CASP5P51878 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CASP5P51878 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CASP5P51878 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CASP5P51878 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CASP5P51878 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CASP5P51878 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CASP5P51878 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
CASP5P51878 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CASP5P51878 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CASP5P51878 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CASP5P51878 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CASP5P51878 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CASP5P51878 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CASP5P51878 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CASP5P51878 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CASP5P51878 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CASP5P51878 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CASP5P51878 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CASP5P51878 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CASP5P51878 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CASP5P51878 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CASP5P51878 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CASP5P51878 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CASP5P51878 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CASP5P51878 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CASP5P51878 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CASP5P51878 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CASP5P51878 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CASP5P51878 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CASP5P51878 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CASP5P51878 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
CASP5P51878 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CASP5P51878 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CASP5P51878 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CASP5P51878 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CASP5P51878 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CASP5P51878 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CASP5P51878 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CASP5P51878 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CASP5P51878 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CASP5P51878 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CASP5P51878 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CASP5P51878 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CASP5P51878 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CASP5P51878 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CASP5P51878 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CASP5P51878 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CASP5P51878 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CASP5P51878 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CASP5P51878 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CASP5P51878 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CASP5P51878 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CASP5P51878 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
CASP5P51878 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CASP5P51878 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CASP5P51878 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CASP5P51878 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CASP5P51878 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CASP5P51878 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CASP5P51878 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms