Protein–RNA interactions for Protein: P51398

DAP3, 28S ribosomal protein S29, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DAP3P51398 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DAP3P51398 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DAP3P51398 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DAP3P51398 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DAP3P51398 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DAP3P51398 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
DAP3P51398 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
DAP3P51398 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
DAP3P51398 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
DAP3P51398 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DAP3P51398 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
DAP3P51398 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DAP3P51398 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
DAP3P51398 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
DAP3P51398 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
DAP3P51398 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
DAP3P51398 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
DAP3P51398 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DAP3P51398 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
DAP3P51398 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
DAP3P51398 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
DAP3P51398 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DAP3P51398 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DAP3P51398 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
DAP3P51398 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
DAP3P51398 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DAP3P51398 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DAP3P51398 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DAP3P51398 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
DAP3P51398 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DAP3P51398 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
DAP3P51398 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DAP3P51398 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DAP3P51398 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DAP3P51398 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
DAP3P51398 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
DAP3P51398 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DAP3P51398 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
DAP3P51398 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
DAP3P51398 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DAP3P51398 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DAP3P51398 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
DAP3P51398 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DAP3P51398 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DAP3P51398 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
DAP3P51398 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
DAP3P51398 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DAP3P51398 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DAP3P51398 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
DAP3P51398 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DAP3P51398 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
DAP3P51398 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
DAP3P51398 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
DAP3P51398 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
DAP3P51398 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
DAP3P51398 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
DAP3P51398 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
DAP3P51398 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
DAP3P51398 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
DAP3P51398 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
DAP3P51398 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
DAP3P51398 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
DAP3P51398 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
DAP3P51398 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DAP3P51398 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DAP3P51398 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
DAP3P51398 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
DAP3P51398 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DAP3P51398 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
DAP3P51398 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DAP3P51398 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DAP3P51398 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DAP3P51398 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
DAP3P51398 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
DAP3P51398 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DAP3P51398 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
DAP3P51398 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DAP3P51398 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
DAP3P51398 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DAP3P51398 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DAP3P51398 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DAP3P51398 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
DAP3P51398 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DAP3P51398 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DAP3P51398 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DAP3P51398 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DAP3P51398 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DAP3P51398 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DAP3P51398 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DAP3P51398 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
DAP3P51398 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DAP3P51398 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DAP3P51398 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DAP3P51398 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DAP3P51398 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DAP3P51398 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DAP3P51398 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DAP3P51398 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DAP3P51398 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
DAP3P51398 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms