Protein–RNA interactions for Protein: P28329

CHAT, Choline O-acetyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHATP28329 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHATP28329 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHATP28329 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHATP28329 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHATP28329 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHATP28329 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHATP28329 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHATP28329 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHATP28329 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHATP28329 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHATP28329 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHATP28329 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHATP28329 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHATP28329 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHATP28329 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHATP28329 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHATP28329 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHATP28329 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHATP28329 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHATP28329 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHATP28329 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHATP28329 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHATP28329 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHATP28329 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHATP28329 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHATP28329 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHATP28329 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHATP28329 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHATP28329 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHATP28329 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CHATP28329 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHATP28329 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHATP28329 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHATP28329 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHATP28329 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHATP28329 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHATP28329 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHATP28329 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CHATP28329 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CHATP28329 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHATP28329 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHATP28329 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHATP28329 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHATP28329 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHATP28329 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHATP28329 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CHATP28329 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHATP28329 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHATP28329 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHATP28329 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHATP28329 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHATP28329 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHATP28329 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CHATP28329 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHATP28329 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHATP28329 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHATP28329 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHATP28329 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHATP28329 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHATP28329 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHATP28329 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHATP28329 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHATP28329 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHATP28329 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHATP28329 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CHATP28329 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHATP28329 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHATP28329 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHATP28329 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHATP28329 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHATP28329 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHATP28329 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHATP28329 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CHATP28329 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHATP28329 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CHATP28329 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHATP28329 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHATP28329 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CHATP28329 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CHATP28329 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CHATP28329 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CHATP28329 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CHATP28329 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CHATP28329 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CHATP28329 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CHATP28329 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CHATP28329 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CHATP28329 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CHATP28329 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CHATP28329 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CHATP28329 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHATP28329 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHATP28329 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHATP28329 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHATP28329 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHATP28329 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHATP28329 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHATP28329 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHATP28329 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHATP28329 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.5 ms