Protein–RNA interactions for Protein: P12980

LYL1, Protein lyl-1, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYL1P12980 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LYL1P12980 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LYL1P12980 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LYL1P12980 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LYL1P12980 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LYL1P12980 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LYL1P12980 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LYL1P12980 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LYL1P12980 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LYL1P12980 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LYL1P12980 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LYL1P12980 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LYL1P12980 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LYL1P12980 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LYL1P12980 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LYL1P12980 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
LYL1P12980 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LYL1P12980 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LYL1P12980 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LYL1P12980 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LYL1P12980 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LYL1P12980 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LYL1P12980 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LYL1P12980 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LYL1P12980 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LYL1P12980 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LYL1P12980 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LYL1P12980 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LYL1P12980 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LYL1P12980 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LYL1P12980 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LYL1P12980 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LYL1P12980 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LYL1P12980 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LYL1P12980 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LYL1P12980 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LYL1P12980 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LYL1P12980 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LYL1P12980 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LYL1P12980 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LYL1P12980 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LYL1P12980 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LYL1P12980 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LYL1P12980 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LYL1P12980 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LYL1P12980 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LYL1P12980 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LYL1P12980 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LYL1P12980 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LYL1P12980 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LYL1P12980 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LYL1P12980 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LYL1P12980 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LYL1P12980 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LYL1P12980 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LYL1P12980 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LYL1P12980 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LYL1P12980 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LYL1P12980 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LYL1P12980 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LYL1P12980 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LYL1P12980 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LYL1P12980 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LYL1P12980 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LYL1P12980 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LYL1P12980 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LYL1P12980 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LYL1P12980 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LYL1P12980 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LYL1P12980 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LYL1P12980 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LYL1P12980 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LYL1P12980 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LYL1P12980 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LYL1P12980 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LYL1P12980 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LYL1P12980 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LYL1P12980 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LYL1P12980 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LYL1P12980 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LYL1P12980 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LYL1P12980 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LYL1P12980 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LYL1P12980 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LYL1P12980 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LYL1P12980 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LYL1P12980 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LYL1P12980 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LYL1P12980 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LYL1P12980 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LYL1P12980 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LYL1P12980 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LYL1P12980 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LYL1P12980 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LYL1P12980 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LYL1P12980 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LYL1P12980 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LYL1P12980 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LYL1P12980 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LYL1P12980 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms