Protein–RNA interactions for Protein: P12271

RLBP1, Retinaldehyde-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLBP1P12271 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RLBP1P12271 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RLBP1P12271 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RLBP1P12271 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RLBP1P12271 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RLBP1P12271 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RLBP1P12271 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RLBP1P12271 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RLBP1P12271 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RLBP1P12271 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RLBP1P12271 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RLBP1P12271 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RLBP1P12271 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
RLBP1P12271 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RLBP1P12271 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
RLBP1P12271 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
RLBP1P12271 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RLBP1P12271 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RLBP1P12271 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RLBP1P12271 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RLBP1P12271 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RLBP1P12271 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RLBP1P12271 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RLBP1P12271 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RLBP1P12271 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RLBP1P12271 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RLBP1P12271 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RLBP1P12271 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RLBP1P12271 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RLBP1P12271 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RLBP1P12271 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RLBP1P12271 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RLBP1P12271 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
RLBP1P12271 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RLBP1P12271 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
RLBP1P12271 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
RLBP1P12271 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RLBP1P12271 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RLBP1P12271 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RLBP1P12271 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RLBP1P12271 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RLBP1P12271 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RLBP1P12271 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
RLBP1P12271 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RLBP1P12271 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RLBP1P12271 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RLBP1P12271 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RLBP1P12271 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RLBP1P12271 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RLBP1P12271 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
RLBP1P12271 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
RLBP1P12271 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RLBP1P12271 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RLBP1P12271 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RLBP1P12271 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RLBP1P12271 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RLBP1P12271 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RLBP1P12271 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RLBP1P12271 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RLBP1P12271 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RLBP1P12271 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RLBP1P12271 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RLBP1P12271 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RLBP1P12271 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RLBP1P12271 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RLBP1P12271 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RLBP1P12271 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RLBP1P12271 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RLBP1P12271 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RLBP1P12271 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RLBP1P12271 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RLBP1P12271 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RLBP1P12271 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RLBP1P12271 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RLBP1P12271 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RLBP1P12271 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RLBP1P12271 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RLBP1P12271 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RLBP1P12271 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RLBP1P12271 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RLBP1P12271 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RLBP1P12271 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RLBP1P12271 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RLBP1P12271 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RLBP1P12271 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RLBP1P12271 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RLBP1P12271 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RLBP1P12271 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RLBP1P12271 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RLBP1P12271 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RLBP1P12271 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
RLBP1P12271 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
RLBP1P12271 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RLBP1P12271 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RLBP1P12271 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RLBP1P12271 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RLBP1P12271 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RLBP1P12271 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RLBP1P12271 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RLBP1P12271 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms