Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
VPREB1P12018 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
VPREB1P12018 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
VPREB1P12018 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
VPREB1P12018 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
VPREB1P12018 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
VPREB1P12018 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
VPREB1P12018 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
VPREB1P12018 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
VPREB1P12018 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
VPREB1P12018 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
VPREB1P12018 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
VPREB1P12018 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
VPREB1P12018 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
VPREB1P12018 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
VPREB1P12018 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
VPREB1P12018 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
VPREB1P12018 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
VPREB1P12018 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
VPREB1P12018 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
VPREB1P12018 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
VPREB1P12018 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC12.1□□□□□ -0.47
VPREB1P12018 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
VPREB1P12018 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
VPREB1P12018 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
VPREB1P12018 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
VPREB1P12018 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
VPREB1P12018 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
VPREB1P12018 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
VPREB1P12018 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
VPREB1P12018 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
VPREB1P12018 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
VPREB1P12018 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
VPREB1P12018 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
VPREB1P12018 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
VPREB1P12018 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
VPREB1P12018 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
VPREB1P12018 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
VPREB1P12018 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
VPREB1P12018 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
VPREB1P12018 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
VPREB1P12018 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
VPREB1P12018 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
VPREB1P12018 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
VPREB1P12018 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
VPREB1P12018 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
VPREB1P12018 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
VPREB1P12018 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
VPREB1P12018 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
VPREB1P12018 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
VPREB1P12018 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
VPREB1P12018 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
VPREB1P12018 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
VPREB1P12018 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
VPREB1P12018 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
VPREB1P12018 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
VPREB1P12018 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
VPREB1P12018 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
VPREB1P12018 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
VPREB1P12018 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
VPREB1P12018 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
VPREB1P12018 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
VPREB1P12018 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
VPREB1P12018 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
VPREB1P12018 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
VPREB1P12018 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
VPREB1P12018 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
VPREB1P12018 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
VPREB1P12018 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
VPREB1P12018 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
VPREB1P12018 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
VPREB1P12018 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
VPREB1P12018 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
VPREB1P12018 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
VPREB1P12018 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
VPREB1P12018 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
VPREB1P12018 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
VPREB1P12018 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
VPREB1P12018 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
VPREB1P12018 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
VPREB1P12018 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
VPREB1P12018 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
VPREB1P12018 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
VPREB1P12018 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
VPREB1P12018 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC12.08□□□□□ -0.47
VPREB1P12018 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
VPREB1P12018 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
VPREB1P12018 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
VPREB1P12018 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
VPREB1P12018 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
VPREB1P12018 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
VPREB1P12018 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
VPREB1P12018 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
VPREB1P12018 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
VPREB1P12018 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
VPREB1P12018 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
VPREB1P12018 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
VPREB1P12018 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
VPREB1P12018 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
VPREB1P12018 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms