Protein–RNA interactions for Protein: O95237

LRAT, Lecithin retinol acyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRATO95237 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LRATO95237 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LRATO95237 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LRATO95237 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LRATO95237 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LRATO95237 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LRATO95237 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LRATO95237 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
LRATO95237 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LRATO95237 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
LRATO95237 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LRATO95237 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LRATO95237 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LRATO95237 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LRATO95237 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LRATO95237 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LRATO95237 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LRATO95237 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LRATO95237 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LRATO95237 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LRATO95237 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LRATO95237 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LRATO95237 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LRATO95237 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LRATO95237 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LRATO95237 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LRATO95237 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LRATO95237 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LRATO95237 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LRATO95237 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LRATO95237 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LRATO95237 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LRATO95237 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LRATO95237 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LRATO95237 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LRATO95237 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LRATO95237 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LRATO95237 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LRATO95237 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
LRATO95237 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
LRATO95237 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LRATO95237 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LRATO95237 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LRATO95237 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LRATO95237 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LRATO95237 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LRATO95237 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LRATO95237 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LRATO95237 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LRATO95237 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LRATO95237 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LRATO95237 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LRATO95237 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LRATO95237 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LRATO95237 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LRATO95237 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LRATO95237 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LRATO95237 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LRATO95237 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LRATO95237 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LRATO95237 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LRATO95237 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LRATO95237 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LRATO95237 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LRATO95237 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LRATO95237 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LRATO95237 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LRATO95237 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LRATO95237 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LRATO95237 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LRATO95237 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LRATO95237 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LRATO95237 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LRATO95237 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LRATO95237 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LRATO95237 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LRATO95237 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LRATO95237 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LRATO95237 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LRATO95237 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LRATO95237 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LRATO95237 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LRATO95237 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LRATO95237 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LRATO95237 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LRATO95237 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LRATO95237 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LRATO95237 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LRATO95237 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LRATO95237 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LRATO95237 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LRATO95237 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LRATO95237 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LRATO95237 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LRATO95237 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LRATO95237 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LRATO95237 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LRATO95237 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LRATO95237 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LRATO95237 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms