Protein–RNA interactions for Protein: O14503

BHLHE40, Class E basic helix-loop-helix protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE40O14503 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
BHLHE40O14503 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
BHLHE40O14503 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
BHLHE40O14503 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
BHLHE40O14503 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
BHLHE40O14503 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
BHLHE40O14503 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
BHLHE40O14503 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
BHLHE40O14503 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
BHLHE40O14503 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
BHLHE40O14503 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
BHLHE40O14503 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
BHLHE40O14503 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
BHLHE40O14503 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
BHLHE40O14503 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
BHLHE40O14503 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
BHLHE40O14503 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
BHLHE40O14503 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
BHLHE40O14503 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
BHLHE40O14503 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
BHLHE40O14503 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
BHLHE40O14503 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
BHLHE40O14503 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
BHLHE40O14503 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
BHLHE40O14503 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
BHLHE40O14503 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
BHLHE40O14503 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
BHLHE40O14503 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
BHLHE40O14503 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
BHLHE40O14503 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
BHLHE40O14503 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
BHLHE40O14503 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
BHLHE40O14503 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
BHLHE40O14503 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
BHLHE40O14503 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
BHLHE40O14503 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
BHLHE40O14503 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
BHLHE40O14503 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
BHLHE40O14503 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
BHLHE40O14503 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
BHLHE40O14503 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
BHLHE40O14503 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
BHLHE40O14503 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
BHLHE40O14503 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
BHLHE40O14503 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
BHLHE40O14503 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
BHLHE40O14503 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
BHLHE40O14503 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
BHLHE40O14503 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
BHLHE40O14503 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
BHLHE40O14503 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
BHLHE40O14503 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
BHLHE40O14503 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
BHLHE40O14503 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
BHLHE40O14503 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
BHLHE40O14503 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
BHLHE40O14503 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
BHLHE40O14503 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
BHLHE40O14503 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
BHLHE40O14503 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
BHLHE40O14503 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
BHLHE40O14503 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
BHLHE40O14503 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
BHLHE40O14503 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
BHLHE40O14503 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
BHLHE40O14503 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
BHLHE40O14503 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
BHLHE40O14503 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
BHLHE40O14503 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
BHLHE40O14503 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
BHLHE40O14503 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
BHLHE40O14503 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
BHLHE40O14503 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
BHLHE40O14503 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
BHLHE40O14503 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
BHLHE40O14503 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
BHLHE40O14503 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
BHLHE40O14503 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
BHLHE40O14503 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
BHLHE40O14503 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
BHLHE40O14503 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
BHLHE40O14503 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
BHLHE40O14503 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
BHLHE40O14503 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
BHLHE40O14503 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
BHLHE40O14503 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
BHLHE40O14503 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
BHLHE40O14503 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
BHLHE40O14503 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
BHLHE40O14503 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
BHLHE40O14503 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
BHLHE40O14503 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
BHLHE40O14503 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
BHLHE40O14503 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
BHLHE40O14503 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
BHLHE40O14503 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
BHLHE40O14503 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
BHLHE40O14503 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
BHLHE40O14503 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
BHLHE40O14503 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms