Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y496

KIF3A, Kinesin-like protein KIF3A, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF3AQ9Y496 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KIF3AQ9Y496 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KIF3AQ9Y496 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KIF3AQ9Y496 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KIF3AQ9Y496 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KIF3AQ9Y496 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KIF3AQ9Y496 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KIF3AQ9Y496 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KIF3AQ9Y496 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KIF3AQ9Y496 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KIF3AQ9Y496 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KIF3AQ9Y496 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KIF3AQ9Y496 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KIF3AQ9Y496 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
KIF3AQ9Y496 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KIF3AQ9Y496 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KIF3AQ9Y496 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KIF3AQ9Y496 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KIF3AQ9Y496 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KIF3AQ9Y496 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KIF3AQ9Y496 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KIF3AQ9Y496 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KIF3AQ9Y496 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KIF3AQ9Y496 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KIF3AQ9Y496 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KIF3AQ9Y496 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KIF3AQ9Y496 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KIF3AQ9Y496 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KIF3AQ9Y496 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KIF3AQ9Y496 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KIF3AQ9Y496 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KIF3AQ9Y496 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KIF3AQ9Y496 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KIF3AQ9Y496 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KIF3AQ9Y496 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
KIF3AQ9Y496 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KIF3AQ9Y496 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KIF3AQ9Y496 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KIF3AQ9Y496 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KIF3AQ9Y496 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KIF3AQ9Y496 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KIF3AQ9Y496 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KIF3AQ9Y496 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KIF3AQ9Y496 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KIF3AQ9Y496 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
KIF3AQ9Y496 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KIF3AQ9Y496 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KIF3AQ9Y496 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KIF3AQ9Y496 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KIF3AQ9Y496 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KIF3AQ9Y496 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KIF3AQ9Y496 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KIF3AQ9Y496 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KIF3AQ9Y496 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KIF3AQ9Y496 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KIF3AQ9Y496 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KIF3AQ9Y496 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KIF3AQ9Y496 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KIF3AQ9Y496 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KIF3AQ9Y496 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KIF3AQ9Y496 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KIF3AQ9Y496 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KIF3AQ9Y496 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KIF3AQ9Y496 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KIF3AQ9Y496 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KIF3AQ9Y496 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
KIF3AQ9Y496 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KIF3AQ9Y496 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KIF3AQ9Y496 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
KIF3AQ9Y496 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KIF3AQ9Y496 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
KIF3AQ9Y496 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KIF3AQ9Y496 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KIF3AQ9Y496 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KIF3AQ9Y496 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KIF3AQ9Y496 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KIF3AQ9Y496 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KIF3AQ9Y496 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KIF3AQ9Y496 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KIF3AQ9Y496 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KIF3AQ9Y496 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KIF3AQ9Y496 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KIF3AQ9Y496 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KIF3AQ9Y496 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KIF3AQ9Y496 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KIF3AQ9Y496 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KIF3AQ9Y496 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KIF3AQ9Y496 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KIF3AQ9Y496 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KIF3AQ9Y496 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KIF3AQ9Y496 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KIF3AQ9Y496 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KIF3AQ9Y496 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KIF3AQ9Y496 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KIF3AQ9Y496 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KIF3AQ9Y496 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KIF3AQ9Y496 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KIF3AQ9Y496 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KIF3AQ9Y496 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KIF3AQ9Y496 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms