Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJJ7

RPUSD1, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 312 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD1Q9UJJ7 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPUSD1Q9UJJ7 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPUSD1Q9UJJ7 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPUSD1Q9UJJ7 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPUSD1Q9UJJ7 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPUSD1Q9UJJ7 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPUSD1Q9UJJ7 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPUSD1Q9UJJ7 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPUSD1Q9UJJ7 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPUSD1Q9UJJ7 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPUSD1Q9UJJ7 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPUSD1Q9UJJ7 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPUSD1Q9UJJ7 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPUSD1Q9UJJ7 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPUSD1Q9UJJ7 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPUSD1Q9UJJ7 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPUSD1Q9UJJ7 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPUSD1Q9UJJ7 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPUSD1Q9UJJ7 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPUSD1Q9UJJ7 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPUSD1Q9UJJ7 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPUSD1Q9UJJ7 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPUSD1Q9UJJ7 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPUSD1Q9UJJ7 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPUSD1Q9UJJ7 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPUSD1Q9UJJ7 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPUSD1Q9UJJ7 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPUSD1Q9UJJ7 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPUSD1Q9UJJ7 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RPUSD1Q9UJJ7 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPUSD1Q9UJJ7 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPUSD1Q9UJJ7 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPUSD1Q9UJJ7 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPUSD1Q9UJJ7 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPUSD1Q9UJJ7 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPUSD1Q9UJJ7 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPUSD1Q9UJJ7 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPUSD1Q9UJJ7 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPUSD1Q9UJJ7 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPUSD1Q9UJJ7 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPUSD1Q9UJJ7 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPUSD1Q9UJJ7 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RPUSD1Q9UJJ7 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPUSD1Q9UJJ7 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPUSD1Q9UJJ7 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPUSD1Q9UJJ7 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPUSD1Q9UJJ7 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPUSD1Q9UJJ7 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RPUSD1Q9UJJ7 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RPUSD1Q9UJJ7 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPUSD1Q9UJJ7 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RPUSD1Q9UJJ7 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPUSD1Q9UJJ7 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPUSD1Q9UJJ7 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPUSD1Q9UJJ7 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPUSD1Q9UJJ7 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPUSD1Q9UJJ7 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPUSD1Q9UJJ7 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPUSD1Q9UJJ7 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPUSD1Q9UJJ7 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPUSD1Q9UJJ7 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPUSD1Q9UJJ7 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPUSD1Q9UJJ7 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPUSD1Q9UJJ7 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPUSD1Q9UJJ7 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPUSD1Q9UJJ7 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPUSD1Q9UJJ7 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPUSD1Q9UJJ7 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPUSD1Q9UJJ7 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPUSD1Q9UJJ7 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPUSD1Q9UJJ7 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPUSD1Q9UJJ7 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPUSD1Q9UJJ7 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPUSD1Q9UJJ7 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RPUSD1Q9UJJ7 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPUSD1Q9UJJ7 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RPUSD1Q9UJJ7 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPUSD1Q9UJJ7 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RPUSD1Q9UJJ7 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPUSD1Q9UJJ7 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPUSD1Q9UJJ7 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RPUSD1Q9UJJ7 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPUSD1Q9UJJ7 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RPUSD1Q9UJJ7 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPUSD1Q9UJJ7 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPUSD1Q9UJJ7 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPUSD1Q9UJJ7 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPUSD1Q9UJJ7 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPUSD1Q9UJJ7 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPUSD1Q9UJJ7 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPUSD1Q9UJJ7 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPUSD1Q9UJJ7 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPUSD1Q9UJJ7 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPUSD1Q9UJJ7 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPUSD1Q9UJJ7 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RPUSD1Q9UJJ7 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RPUSD1Q9UJJ7 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RPUSD1Q9UJJ7 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RPUSD1Q9UJJ7 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RPUSD1Q9UJJ7 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
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