Protein–RNA interactions for Protein: Q9P219

CCDC88C, Protein Daple, humanhuman

Predictions only

Length 2,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC88CQ9P219 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC88CQ9P219 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC88CQ9P219 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC88CQ9P219 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC88CQ9P219 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC88CQ9P219 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC88CQ9P219 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC88CQ9P219 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC88CQ9P219 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC88CQ9P219 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC88CQ9P219 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC88CQ9P219 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC88CQ9P219 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC88CQ9P219 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC88CQ9P219 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC88CQ9P219 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC88CQ9P219 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC88CQ9P219 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC88CQ9P219 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC88CQ9P219 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC88CQ9P219 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC88CQ9P219 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC88CQ9P219 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC88CQ9P219 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC88CQ9P219 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC88CQ9P219 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC88CQ9P219 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC88CQ9P219 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC88CQ9P219 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC88CQ9P219 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC88CQ9P219 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC88CQ9P219 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC88CQ9P219 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC88CQ9P219 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC88CQ9P219 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC88CQ9P219 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC88CQ9P219 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC88CQ9P219 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC88CQ9P219 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC88CQ9P219 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC88CQ9P219 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC88CQ9P219 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC88CQ9P219 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC88CQ9P219 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC88CQ9P219 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC88CQ9P219 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC88CQ9P219 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC88CQ9P219 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC88CQ9P219 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC88CQ9P219 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC88CQ9P219 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC88CQ9P219 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC88CQ9P219 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC88CQ9P219 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC88CQ9P219 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC88CQ9P219 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC88CQ9P219 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC88CQ9P219 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC88CQ9P219 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC88CQ9P219 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC88CQ9P219 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC88CQ9P219 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC88CQ9P219 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC88CQ9P219 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC88CQ9P219 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC88CQ9P219 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC88CQ9P219 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC88CQ9P219 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC88CQ9P219 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC88CQ9P219 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC88CQ9P219 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC88CQ9P219 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC88CQ9P219 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC88CQ9P219 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC88CQ9P219 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC88CQ9P219 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC88CQ9P219 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC88CQ9P219 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC88CQ9P219 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC88CQ9P219 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC88CQ9P219 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC88CQ9P219 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC88CQ9P219 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC88CQ9P219 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC88CQ9P219 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC88CQ9P219 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC88CQ9P219 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC88CQ9P219 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC88CQ9P219 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC88CQ9P219 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC88CQ9P219 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC88CQ9P219 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC88CQ9P219 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC88CQ9P219 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC88CQ9P219 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC88CQ9P219 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC88CQ9P219 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC88CQ9P219 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC88CQ9P219 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC88CQ9P219 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms