Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXN4

GDAP2, Ganglioside-induced differentiation-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 497 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDAP2Q9NXN4 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GDAP2Q9NXN4 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GDAP2Q9NXN4 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
GDAP2Q9NXN4 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
GDAP2Q9NXN4 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GDAP2Q9NXN4 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
GDAP2Q9NXN4 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GDAP2Q9NXN4 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GDAP2Q9NXN4 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GDAP2Q9NXN4 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GDAP2Q9NXN4 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
GDAP2Q9NXN4 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
GDAP2Q9NXN4 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
GDAP2Q9NXN4 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC20■□□□□ 0.79
GDAP2Q9NXN4 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
GDAP2Q9NXN4 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
GDAP2Q9NXN4 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GDAP2Q9NXN4 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GDAP2Q9NXN4 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GDAP2Q9NXN4 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC20■□□□□ 0.79
GDAP2Q9NXN4 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
GDAP2Q9NXN4 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
GDAP2Q9NXN4 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
GDAP2Q9NXN4 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GDAP2Q9NXN4 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GDAP2Q9NXN4 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GDAP2Q9NXN4 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GDAP2Q9NXN4 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GDAP2Q9NXN4 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GDAP2Q9NXN4 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GDAP2Q9NXN4 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GDAP2Q9NXN4 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GDAP2Q9NXN4 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GDAP2Q9NXN4 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GDAP2Q9NXN4 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GDAP2Q9NXN4 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GDAP2Q9NXN4 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GDAP2Q9NXN4 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GDAP2Q9NXN4 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GDAP2Q9NXN4 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
GDAP2Q9NXN4 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GDAP2Q9NXN4 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
GDAP2Q9NXN4 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GDAP2Q9NXN4 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GDAP2Q9NXN4 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GDAP2Q9NXN4 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GDAP2Q9NXN4 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
GDAP2Q9NXN4 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GDAP2Q9NXN4 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GDAP2Q9NXN4 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GDAP2Q9NXN4 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GDAP2Q9NXN4 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GDAP2Q9NXN4 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GDAP2Q9NXN4 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GDAP2Q9NXN4 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GDAP2Q9NXN4 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GDAP2Q9NXN4 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GDAP2Q9NXN4 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GDAP2Q9NXN4 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GDAP2Q9NXN4 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GDAP2Q9NXN4 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GDAP2Q9NXN4 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GDAP2Q9NXN4 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GDAP2Q9NXN4 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GDAP2Q9NXN4 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GDAP2Q9NXN4 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GDAP2Q9NXN4 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GDAP2Q9NXN4 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GDAP2Q9NXN4 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GDAP2Q9NXN4 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GDAP2Q9NXN4 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GDAP2Q9NXN4 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GDAP2Q9NXN4 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GDAP2Q9NXN4 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GDAP2Q9NXN4 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GDAP2Q9NXN4 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GDAP2Q9NXN4 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GDAP2Q9NXN4 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GDAP2Q9NXN4 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GDAP2Q9NXN4 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
GDAP2Q9NXN4 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GDAP2Q9NXN4 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
GDAP2Q9NXN4 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GDAP2Q9NXN4 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
GDAP2Q9NXN4 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GDAP2Q9NXN4 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GDAP2Q9NXN4 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GDAP2Q9NXN4 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GDAP2Q9NXN4 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GDAP2Q9NXN4 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GDAP2Q9NXN4 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GDAP2Q9NXN4 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GDAP2Q9NXN4 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
GDAP2Q9NXN4 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GDAP2Q9NXN4 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GDAP2Q9NXN4 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GDAP2Q9NXN4 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GDAP2Q9NXN4 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GDAP2Q9NXN4 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GDAP2Q9NXN4 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms