Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWW5

CLN6, Ceroid-lipofuscinosis neuronal protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN6Q9NWW5 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLN6Q9NWW5 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLN6Q9NWW5 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLN6Q9NWW5 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLN6Q9NWW5 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLN6Q9NWW5 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLN6Q9NWW5 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLN6Q9NWW5 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLN6Q9NWW5 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLN6Q9NWW5 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLN6Q9NWW5 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLN6Q9NWW5 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLN6Q9NWW5 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLN6Q9NWW5 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLN6Q9NWW5 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLN6Q9NWW5 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLN6Q9NWW5 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLN6Q9NWW5 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLN6Q9NWW5 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLN6Q9NWW5 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLN6Q9NWW5 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLN6Q9NWW5 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLN6Q9NWW5 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLN6Q9NWW5 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLN6Q9NWW5 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLN6Q9NWW5 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLN6Q9NWW5 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLN6Q9NWW5 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CLN6Q9NWW5 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLN6Q9NWW5 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLN6Q9NWW5 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLN6Q9NWW5 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLN6Q9NWW5 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLN6Q9NWW5 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLN6Q9NWW5 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLN6Q9NWW5 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLN6Q9NWW5 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLN6Q9NWW5 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLN6Q9NWW5 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLN6Q9NWW5 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLN6Q9NWW5 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CLN6Q9NWW5 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLN6Q9NWW5 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLN6Q9NWW5 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLN6Q9NWW5 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLN6Q9NWW5 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLN6Q9NWW5 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CLN6Q9NWW5 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLN6Q9NWW5 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLN6Q9NWW5 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLN6Q9NWW5 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLN6Q9NWW5 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLN6Q9NWW5 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLN6Q9NWW5 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLN6Q9NWW5 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLN6Q9NWW5 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLN6Q9NWW5 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLN6Q9NWW5 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLN6Q9NWW5 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLN6Q9NWW5 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLN6Q9NWW5 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLN6Q9NWW5 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLN6Q9NWW5 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLN6Q9NWW5 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLN6Q9NWW5 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLN6Q9NWW5 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLN6Q9NWW5 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLN6Q9NWW5 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLN6Q9NWW5 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLN6Q9NWW5 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLN6Q9NWW5 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLN6Q9NWW5 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLN6Q9NWW5 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLN6Q9NWW5 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLN6Q9NWW5 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLN6Q9NWW5 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLN6Q9NWW5 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLN6Q9NWW5 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLN6Q9NWW5 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLN6Q9NWW5 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLN6Q9NWW5 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLN6Q9NWW5 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLN6Q9NWW5 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLN6Q9NWW5 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLN6Q9NWW5 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLN6Q9NWW5 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLN6Q9NWW5 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLN6Q9NWW5 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLN6Q9NWW5 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLN6Q9NWW5 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLN6Q9NWW5 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLN6Q9NWW5 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLN6Q9NWW5 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CLN6Q9NWW5 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CLN6Q9NWW5 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLN6Q9NWW5 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLN6Q9NWW5 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLN6Q9NWW5 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLN6Q9NWW5 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLN6Q9NWW5 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms