Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA0

KATNB1, Katanin p80 WD40 repeat-containing subunit B1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KATNB1Q9BVA0 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KATNB1Q9BVA0 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KATNB1Q9BVA0 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KATNB1Q9BVA0 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KATNB1Q9BVA0 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KATNB1Q9BVA0 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KATNB1Q9BVA0 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KATNB1Q9BVA0 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KATNB1Q9BVA0 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KATNB1Q9BVA0 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KATNB1Q9BVA0 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KATNB1Q9BVA0 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KATNB1Q9BVA0 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KATNB1Q9BVA0 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KATNB1Q9BVA0 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KATNB1Q9BVA0 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KATNB1Q9BVA0 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KATNB1Q9BVA0 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KATNB1Q9BVA0 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KATNB1Q9BVA0 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KATNB1Q9BVA0 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KATNB1Q9BVA0 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KATNB1Q9BVA0 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KATNB1Q9BVA0 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KATNB1Q9BVA0 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KATNB1Q9BVA0 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KATNB1Q9BVA0 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KATNB1Q9BVA0 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KATNB1Q9BVA0 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KATNB1Q9BVA0 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KATNB1Q9BVA0 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KATNB1Q9BVA0 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KATNB1Q9BVA0 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
KATNB1Q9BVA0 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KATNB1Q9BVA0 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KATNB1Q9BVA0 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
KATNB1Q9BVA0 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KATNB1Q9BVA0 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KATNB1Q9BVA0 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KATNB1Q9BVA0 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KATNB1Q9BVA0 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KATNB1Q9BVA0 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KATNB1Q9BVA0 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KATNB1Q9BVA0 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KATNB1Q9BVA0 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KATNB1Q9BVA0 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KATNB1Q9BVA0 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KATNB1Q9BVA0 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KATNB1Q9BVA0 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KATNB1Q9BVA0 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KATNB1Q9BVA0 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KATNB1Q9BVA0 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KATNB1Q9BVA0 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KATNB1Q9BVA0 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KATNB1Q9BVA0 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KATNB1Q9BVA0 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KATNB1Q9BVA0 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KATNB1Q9BVA0 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KATNB1Q9BVA0 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KATNB1Q9BVA0 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KATNB1Q9BVA0 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
KATNB1Q9BVA0 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KATNB1Q9BVA0 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KATNB1Q9BVA0 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
KATNB1Q9BVA0 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KATNB1Q9BVA0 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KATNB1Q9BVA0 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KATNB1Q9BVA0 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KATNB1Q9BVA0 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
KATNB1Q9BVA0 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KATNB1Q9BVA0 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KATNB1Q9BVA0 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KATNB1Q9BVA0 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KATNB1Q9BVA0 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KATNB1Q9BVA0 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KATNB1Q9BVA0 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KATNB1Q9BVA0 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KATNB1Q9BVA0 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KATNB1Q9BVA0 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KATNB1Q9BVA0 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KATNB1Q9BVA0 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KATNB1Q9BVA0 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KATNB1Q9BVA0 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KATNB1Q9BVA0 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KATNB1Q9BVA0 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KATNB1Q9BVA0 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KATNB1Q9BVA0 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KATNB1Q9BVA0 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KATNB1Q9BVA0 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KATNB1Q9BVA0 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KATNB1Q9BVA0 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KATNB1Q9BVA0 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KATNB1Q9BVA0 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KATNB1Q9BVA0 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KATNB1Q9BVA0 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KATNB1Q9BVA0 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KATNB1Q9BVA0 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KATNB1Q9BVA0 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KATNB1Q9BVA0 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KATNB1Q9BVA0 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms