Protein–RNA interactions for Protein: Q96JN2

CCDC136, Coiled-coil domain-containing protein 136, humanhuman

Predictions only

Length 1,154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC136Q96JN2 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC136Q96JN2 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC136Q96JN2 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC136Q96JN2 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC136Q96JN2 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC136Q96JN2 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC136Q96JN2 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC136Q96JN2 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC136Q96JN2 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC136Q96JN2 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC136Q96JN2 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC136Q96JN2 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC136Q96JN2 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC136Q96JN2 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC136Q96JN2 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC136Q96JN2 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC136Q96JN2 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC136Q96JN2 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC136Q96JN2 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC136Q96JN2 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC136Q96JN2 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC136Q96JN2 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC136Q96JN2 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC136Q96JN2 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC136Q96JN2 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC136Q96JN2 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC136Q96JN2 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC136Q96JN2 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC136Q96JN2 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC136Q96JN2 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC136Q96JN2 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC136Q96JN2 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC136Q96JN2 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC136Q96JN2 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC136Q96JN2 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC136Q96JN2 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC136Q96JN2 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC136Q96JN2 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC136Q96JN2 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC136Q96JN2 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC136Q96JN2 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC136Q96JN2 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC136Q96JN2 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC136Q96JN2 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC136Q96JN2 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC136Q96JN2 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC136Q96JN2 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC136Q96JN2 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC136Q96JN2 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC136Q96JN2 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC136Q96JN2 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC136Q96JN2 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC136Q96JN2 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC136Q96JN2 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC136Q96JN2 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC136Q96JN2 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC136Q96JN2 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC136Q96JN2 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC136Q96JN2 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC136Q96JN2 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC136Q96JN2 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC136Q96JN2 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC136Q96JN2 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC136Q96JN2 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC136Q96JN2 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC136Q96JN2 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC136Q96JN2 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC136Q96JN2 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC136Q96JN2 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC136Q96JN2 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC136Q96JN2 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC136Q96JN2 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC136Q96JN2 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC136Q96JN2 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC136Q96JN2 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC136Q96JN2 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC136Q96JN2 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC136Q96JN2 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC136Q96JN2 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC136Q96JN2 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC136Q96JN2 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC136Q96JN2 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC136Q96JN2 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC136Q96JN2 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC136Q96JN2 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC136Q96JN2 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC136Q96JN2 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC136Q96JN2 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC136Q96JN2 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC136Q96JN2 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC136Q96JN2 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC136Q96JN2 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC136Q96JN2 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC136Q96JN2 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC136Q96JN2 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC136Q96JN2 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC136Q96JN2 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC136Q96JN2 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC136Q96JN2 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC136Q96JN2 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms