Protein–RNA interactions for Protein: Q96DX7

TRIM44, Tripartite motif-containing protein 44, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM44Q96DX7 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM44Q96DX7 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRIM44Q96DX7 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TRIM44Q96DX7 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TRIM44Q96DX7 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRIM44Q96DX7 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRIM44Q96DX7 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TRIM44Q96DX7 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRIM44Q96DX7 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRIM44Q96DX7 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRIM44Q96DX7 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRIM44Q96DX7 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRIM44Q96DX7 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRIM44Q96DX7 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRIM44Q96DX7 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
TRIM44Q96DX7 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TRIM44Q96DX7 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRIM44Q96DX7 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TRIM44Q96DX7 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRIM44Q96DX7 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRIM44Q96DX7 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRIM44Q96DX7 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
TRIM44Q96DX7 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TRIM44Q96DX7 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRIM44Q96DX7 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRIM44Q96DX7 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRIM44Q96DX7 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRIM44Q96DX7 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRIM44Q96DX7 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TRIM44Q96DX7 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
TRIM44Q96DX7 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRIM44Q96DX7 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRIM44Q96DX7 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM44Q96DX7 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM44Q96DX7 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM44Q96DX7 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM44Q96DX7 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM44Q96DX7 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM44Q96DX7 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM44Q96DX7 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM44Q96DX7 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM44Q96DX7 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM44Q96DX7 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM44Q96DX7 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM44Q96DX7 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM44Q96DX7 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM44Q96DX7 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM44Q96DX7 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM44Q96DX7 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM44Q96DX7 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM44Q96DX7 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM44Q96DX7 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM44Q96DX7 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM44Q96DX7 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM44Q96DX7 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM44Q96DX7 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM44Q96DX7 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM44Q96DX7 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM44Q96DX7 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM44Q96DX7 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM44Q96DX7 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TRIM44Q96DX7 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM44Q96DX7 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM44Q96DX7 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM44Q96DX7 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM44Q96DX7 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM44Q96DX7 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM44Q96DX7 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM44Q96DX7 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM44Q96DX7 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM44Q96DX7 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM44Q96DX7 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM44Q96DX7 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM44Q96DX7 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM44Q96DX7 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM44Q96DX7 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM44Q96DX7 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM44Q96DX7 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM44Q96DX7 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM44Q96DX7 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM44Q96DX7 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM44Q96DX7 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM44Q96DX7 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM44Q96DX7 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM44Q96DX7 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TRIM44Q96DX7 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TRIM44Q96DX7 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM44Q96DX7 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM44Q96DX7 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM44Q96DX7 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM44Q96DX7 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM44Q96DX7 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM44Q96DX7 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TRIM44Q96DX7 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM44Q96DX7 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM44Q96DX7 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TRIM44Q96DX7 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRIM44Q96DX7 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRIM44Q96DX7 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRIM44Q96DX7 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms