Protein–RNA interactions for Protein: Q92572

AP3S1, AP-3 complex subunit sigma-1, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3S1Q92572 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
AP3S1Q92572 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
AP3S1Q92572 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
AP3S1Q92572 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
AP3S1Q92572 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
AP3S1Q92572 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
AP3S1Q92572 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
AP3S1Q92572 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
AP3S1Q92572 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
AP3S1Q92572 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
AP3S1Q92572 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
AP3S1Q92572 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
AP3S1Q92572 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
AP3S1Q92572 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
AP3S1Q92572 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
AP3S1Q92572 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
AP3S1Q92572 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
AP3S1Q92572 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
AP3S1Q92572 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
AP3S1Q92572 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
AP3S1Q92572 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
AP3S1Q92572 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
AP3S1Q92572 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
AP3S1Q92572 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
AP3S1Q92572 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
AP3S1Q92572 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
AP3S1Q92572 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
AP3S1Q92572 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
AP3S1Q92572 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
AP3S1Q92572 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
AP3S1Q92572 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
AP3S1Q92572 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
AP3S1Q92572 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
AP3S1Q92572 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
AP3S1Q92572 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
AP3S1Q92572 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
AP3S1Q92572 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
AP3S1Q92572 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
AP3S1Q92572 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
AP3S1Q92572 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
AP3S1Q92572 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
AP3S1Q92572 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
AP3S1Q92572 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
AP3S1Q92572 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
AP3S1Q92572 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
AP3S1Q92572 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
AP3S1Q92572 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
AP3S1Q92572 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
AP3S1Q92572 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
AP3S1Q92572 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
AP3S1Q92572 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
AP3S1Q92572 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
AP3S1Q92572 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
AP3S1Q92572 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
AP3S1Q92572 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
AP3S1Q92572 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
AP3S1Q92572 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
AP3S1Q92572 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
AP3S1Q92572 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
AP3S1Q92572 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
AP3S1Q92572 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
AP3S1Q92572 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
AP3S1Q92572 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AP3S1Q92572 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
AP3S1Q92572 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AP3S1Q92572 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
AP3S1Q92572 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
AP3S1Q92572 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
AP3S1Q92572 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AP3S1Q92572 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AP3S1Q92572 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AP3S1Q92572 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
AP3S1Q92572 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AP3S1Q92572 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AP3S1Q92572 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
AP3S1Q92572 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AP3S1Q92572 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AP3S1Q92572 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
AP3S1Q92572 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
AP3S1Q92572 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
AP3S1Q92572 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AP3S1Q92572 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AP3S1Q92572 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AP3S1Q92572 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AP3S1Q92572 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
AP3S1Q92572 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
AP3S1Q92572 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
AP3S1Q92572 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AP3S1Q92572 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
AP3S1Q92572 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AP3S1Q92572 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AP3S1Q92572 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
AP3S1Q92572 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
AP3S1Q92572 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AP3S1Q92572 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AP3S1Q92572 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AP3S1Q92572 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
AP3S1Q92572 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AP3S1Q92572 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AP3S1Q92572 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms