Protein–RNA interactions for Protein: Q92546

RGP1, RAB6A-GEF complex partner protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGP1Q92546 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RGP1Q92546 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RGP1Q92546 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RGP1Q92546 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RGP1Q92546 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RGP1Q92546 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RGP1Q92546 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RGP1Q92546 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RGP1Q92546 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RGP1Q92546 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RGP1Q92546 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RGP1Q92546 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RGP1Q92546 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RGP1Q92546 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RGP1Q92546 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RGP1Q92546 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RGP1Q92546 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RGP1Q92546 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RGP1Q92546 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RGP1Q92546 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RGP1Q92546 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RGP1Q92546 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RGP1Q92546 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RGP1Q92546 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RGP1Q92546 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RGP1Q92546 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RGP1Q92546 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RGP1Q92546 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RGP1Q92546 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RGP1Q92546 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RGP1Q92546 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
RGP1Q92546 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RGP1Q92546 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RGP1Q92546 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RGP1Q92546 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RGP1Q92546 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RGP1Q92546 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RGP1Q92546 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RGP1Q92546 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RGP1Q92546 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RGP1Q92546 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RGP1Q92546 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RGP1Q92546 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RGP1Q92546 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RGP1Q92546 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RGP1Q92546 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RGP1Q92546 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RGP1Q92546 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RGP1Q92546 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RGP1Q92546 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RGP1Q92546 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RGP1Q92546 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RGP1Q92546 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RGP1Q92546 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RGP1Q92546 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RGP1Q92546 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RGP1Q92546 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RGP1Q92546 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RGP1Q92546 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RGP1Q92546 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RGP1Q92546 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RGP1Q92546 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RGP1Q92546 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RGP1Q92546 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RGP1Q92546 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RGP1Q92546 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RGP1Q92546 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RGP1Q92546 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RGP1Q92546 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RGP1Q92546 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RGP1Q92546 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RGP1Q92546 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RGP1Q92546 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RGP1Q92546 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RGP1Q92546 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RGP1Q92546 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RGP1Q92546 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RGP1Q92546 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RGP1Q92546 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RGP1Q92546 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RGP1Q92546 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RGP1Q92546 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RGP1Q92546 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RGP1Q92546 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RGP1Q92546 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RGP1Q92546 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
RGP1Q92546 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RGP1Q92546 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RGP1Q92546 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RGP1Q92546 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RGP1Q92546 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RGP1Q92546 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RGP1Q92546 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RGP1Q92546 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RGP1Q92546 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
RGP1Q92546 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RGP1Q92546 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RGP1Q92546 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RGP1Q92546 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RGP1Q92546 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms