Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWF9

CCDC83, Coiled-coil domain-containing protein 83, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC83Q8IWF9 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC83Q8IWF9 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC83Q8IWF9 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC83Q8IWF9 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC83Q8IWF9 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC83Q8IWF9 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC83Q8IWF9 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC83Q8IWF9 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC83Q8IWF9 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC83Q8IWF9 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC83Q8IWF9 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC83Q8IWF9 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC83Q8IWF9 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC83Q8IWF9 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC83Q8IWF9 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC83Q8IWF9 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC83Q8IWF9 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC83Q8IWF9 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC83Q8IWF9 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC83Q8IWF9 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC83Q8IWF9 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC83Q8IWF9 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC83Q8IWF9 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC83Q8IWF9 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC83Q8IWF9 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC83Q8IWF9 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC83Q8IWF9 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC83Q8IWF9 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC83Q8IWF9 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC83Q8IWF9 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC83Q8IWF9 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC83Q8IWF9 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC83Q8IWF9 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC83Q8IWF9 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC83Q8IWF9 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC83Q8IWF9 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC83Q8IWF9 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC83Q8IWF9 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC83Q8IWF9 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC83Q8IWF9 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC83Q8IWF9 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC83Q8IWF9 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC83Q8IWF9 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC83Q8IWF9 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC83Q8IWF9 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC83Q8IWF9 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC83Q8IWF9 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC83Q8IWF9 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC83Q8IWF9 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC83Q8IWF9 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC83Q8IWF9 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC83Q8IWF9 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC83Q8IWF9 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC83Q8IWF9 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC83Q8IWF9 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC83Q8IWF9 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC83Q8IWF9 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC83Q8IWF9 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC83Q8IWF9 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC83Q8IWF9 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC83Q8IWF9 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC83Q8IWF9 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC83Q8IWF9 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC83Q8IWF9 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC83Q8IWF9 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC83Q8IWF9 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC83Q8IWF9 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC83Q8IWF9 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC83Q8IWF9 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC83Q8IWF9 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC83Q8IWF9 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC83Q8IWF9 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC83Q8IWF9 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC83Q8IWF9 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC83Q8IWF9 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC83Q8IWF9 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC83Q8IWF9 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC83Q8IWF9 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC83Q8IWF9 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC83Q8IWF9 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC83Q8IWF9 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC83Q8IWF9 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC83Q8IWF9 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC83Q8IWF9 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC83Q8IWF9 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC83Q8IWF9 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC83Q8IWF9 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC83Q8IWF9 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC83Q8IWF9 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC83Q8IWF9 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC83Q8IWF9 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC83Q8IWF9 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC83Q8IWF9 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC83Q8IWF9 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC83Q8IWF9 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC83Q8IWF9 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC83Q8IWF9 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC83Q8IWF9 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC83Q8IWF9 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC83Q8IWF9 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms