Protein–RNA interactions for Protein: Q6L9W6

B4GALNT3, Beta-1,4-N-acetylgalactosaminyltransferase 3, humanhuman

Predictions only

Length 998 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4GALNT3Q6L9W6 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
B4GALNT3Q6L9W6 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
B4GALNT3Q6L9W6 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
B4GALNT3Q6L9W6 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
B4GALNT3Q6L9W6 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
B4GALNT3Q6L9W6 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
B4GALNT3Q6L9W6 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
B4GALNT3Q6L9W6 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
B4GALNT3Q6L9W6 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
B4GALNT3Q6L9W6 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
B4GALNT3Q6L9W6 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
B4GALNT3Q6L9W6 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
B4GALNT3Q6L9W6 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
B4GALNT3Q6L9W6 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
B4GALNT3Q6L9W6 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
B4GALNT3Q6L9W6 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
B4GALNT3Q6L9W6 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
B4GALNT3Q6L9W6 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
B4GALNT3Q6L9W6 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
B4GALNT3Q6L9W6 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
B4GALNT3Q6L9W6 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
B4GALNT3Q6L9W6 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
B4GALNT3Q6L9W6 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
B4GALNT3Q6L9W6 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
B4GALNT3Q6L9W6 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
B4GALNT3Q6L9W6 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
B4GALNT3Q6L9W6 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
B4GALNT3Q6L9W6 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
B4GALNT3Q6L9W6 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
B4GALNT3Q6L9W6 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
B4GALNT3Q6L9W6 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
B4GALNT3Q6L9W6 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
B4GALNT3Q6L9W6 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
B4GALNT3Q6L9W6 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
B4GALNT3Q6L9W6 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
B4GALNT3Q6L9W6 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
B4GALNT3Q6L9W6 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
B4GALNT3Q6L9W6 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
B4GALNT3Q6L9W6 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
B4GALNT3Q6L9W6 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
B4GALNT3Q6L9W6 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
B4GALNT3Q6L9W6 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
B4GALNT3Q6L9W6 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
B4GALNT3Q6L9W6 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
B4GALNT3Q6L9W6 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
B4GALNT3Q6L9W6 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
B4GALNT3Q6L9W6 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
B4GALNT3Q6L9W6 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
B4GALNT3Q6L9W6 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
B4GALNT3Q6L9W6 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
B4GALNT3Q6L9W6 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
B4GALNT3Q6L9W6 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
B4GALNT3Q6L9W6 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
B4GALNT3Q6L9W6 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
B4GALNT3Q6L9W6 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
B4GALNT3Q6L9W6 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
B4GALNT3Q6L9W6 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
B4GALNT3Q6L9W6 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
B4GALNT3Q6L9W6 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
B4GALNT3Q6L9W6 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
B4GALNT3Q6L9W6 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
B4GALNT3Q6L9W6 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
B4GALNT3Q6L9W6 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
B4GALNT3Q6L9W6 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
B4GALNT3Q6L9W6 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
B4GALNT3Q6L9W6 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
B4GALNT3Q6L9W6 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
B4GALNT3Q6L9W6 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
B4GALNT3Q6L9W6 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
B4GALNT3Q6L9W6 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
B4GALNT3Q6L9W6 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
B4GALNT3Q6L9W6 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
B4GALNT3Q6L9W6 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
B4GALNT3Q6L9W6 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
B4GALNT3Q6L9W6 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
B4GALNT3Q6L9W6 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
B4GALNT3Q6L9W6 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
B4GALNT3Q6L9W6 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
B4GALNT3Q6L9W6 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
B4GALNT3Q6L9W6 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
B4GALNT3Q6L9W6 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
B4GALNT3Q6L9W6 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
B4GALNT3Q6L9W6 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
B4GALNT3Q6L9W6 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
B4GALNT3Q6L9W6 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
B4GALNT3Q6L9W6 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
B4GALNT3Q6L9W6 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
B4GALNT3Q6L9W6 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
B4GALNT3Q6L9W6 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
B4GALNT3Q6L9W6 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
B4GALNT3Q6L9W6 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
B4GALNT3Q6L9W6 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
B4GALNT3Q6L9W6 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.47
B4GALNT3Q6L9W6 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
B4GALNT3Q6L9W6 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.47
B4GALNT3Q6L9W6 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
B4GALNT3Q6L9W6 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.47
B4GALNT3Q6L9W6 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
B4GALNT3Q6L9W6 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
B4GALNT3Q6L9W6 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms